| 胃癌相关长链非编码RNA的生物信息学筛选 |
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| 引用本文： | 李淑娜,邹国英,陈淑敏,李超然,何姝仪,张文玲. 胃癌相关长链非编码RNA的生物信息学筛选[J]. 临床检验杂志, 2015, 0(10): 789-792 |
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| 作者姓名： | 李淑娜 邹国英 陈淑敏 李超然 何姝仪 张文玲 |
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| 作者单位： | 中南大学湘雅医学院医学检验系，长沙 410013;中南大学湘雅医学院医学检验系，长沙 410013;中南大学湘雅医学院医学检验系，长沙 410013;中南大学湘雅医学院医学检验系，长沙 410013;中南大学湘雅医学院医学检验系，长沙 410013;中南大学湘雅医学院医学检验系，长沙 410013 |
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| 摘 要： | ![]()
目的用生物信息学方法筛选胃癌中差异表达的长链非编码RNA。方法于NCBI公共数据平台GEO下载胃癌基因芯片数据GSE33335,用SAM软件对其进行差异表达分析,对差异表达基因进行重注释并筛选其中的长链非编码RNA,用Gene Cluster和Tree View软件对筛选出的长链非编码RNA的表达情况予以验证。结果针对该芯片数据,筛选出胃癌中差异表达的非编码RNA 15个,其中,表达上调的12个,表达下调的3个,这15个非编码RNA表达值倍数均2或0.5(q均0.05)。结论用生物信息学方法筛选胃癌相关的长链非编码RNA是一种非常高效的手段,能为胃癌相关肿瘤标志物的探索提供理论依据。
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| 关 键 词： | 胃癌；长链非编码RNA；生物信息学 |
| 收稿时间： | 2015-08-09 |
Screening of differential expression in gastric carcinoma associated long non-coding RNA by bioinformatics approach |
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| Abstract: | ![]()
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