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基于生物信息学的青藤碱治疗类风湿关节炎作用机制研究
引用本文:尚昱志,韦露秋,陈秋霞,唐秀松,方刚,张青槐,黄安,庞宇舟. 基于生物信息学的青藤碱治疗类风湿关节炎作用机制研究[J]. 中国现代中药, 2020, 22(10): 1668-1674
作者姓名:尚昱志  韦露秋  陈秋霞  唐秀松  方刚  张青槐  黄安  庞宇舟
作者单位:广西中医药大学,广西南宁530200
基金项目:国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项(2017YFC1704004);国家自然科学基金项目(81973976);广西中医药大学广西一流学科建设开放课题(2019XK036,2019XK038);广西中医药大学岐黄工程高层次人才团队培育项目(2018005);广西中医药大学硕士研究生科研创新项目(YCSY20190010)
摘    要:目的:通过分子反向对接和网络药理学预测青藤碱(SN)治疗类风湿关节炎(RA)的潜在靶点、通路,探究SN治疗RA的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)评估SN的可药性,将药物再定位及药物不良反应预测服务器(DRAR-CPI)预测出的SN潜在靶点与DisGeNET数据库中查询到的RA靶点作交集,以获取SN治疗RA的潜在靶点,利用GeneMANIA构建靶点间相互关系网络及筛选hub靶点,利用KOBAS 3.0和Omicshare平台工具等进行基因本体(GO)、京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:SN的理化性质表明其具有良好的可药性。预测出SN治疗RA的潜在靶点47个,相关潜在靶点间存在共表达特征、可预测到的相互作用关系等关联,并筛选出蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、硫氧还蛋白(TXN)3个hub靶点。GO富集结果涉及16个生物学过程、7个分子功能及10个细胞组件,KEGG显著富集通路的前10条通路包括细胞凋亡通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、低氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、Ras相关蛋白1(Rap1)信号通路等。结论:SN可能通过作用于AKT1、TP53、TXN、白细胞介素-10(IL-10)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等靶点及细胞凋亡、TNF信号通路、HIF-1信号通路、相关蛋白Rap1信号通路等通路影响RA的疾病过程,为后期相关实验验证及临床应用研究提供了数据支撑。

关 键 词:反向分子对接;网络药理学;生物信息学;青藤碱;类风湿关节炎;作用机制
收稿时间:2019-10-29

Research on Mechanism of Sinomenine in Treating Rheumatoid Arthritis via Bioinformatics
SHANG Yu-zhi,WEI Lu-qiu,CHEN Qiu-xi,TANG Xiu-song,FANG Gang,ZHANG Qing-huai,HUANG An,PANG Yu-zhou. Research on Mechanism of Sinomenine in Treating Rheumatoid Arthritis via Bioinformatics[J]. Modern Chinese Medicine, 2020, 22(10): 1668-1674
Authors:SHANG Yu-zhi  WEI Lu-qiu  CHEN Qiu-xi  TANG Xiu-song  FANG Gang  ZHANG Qing-huai  HUANG An  PANG Yu-zhou
Abstract:
Keywords:
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