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| 重亚硫酸盐修饰直接测序技术检测p16基因甲基化的研究 | |
| 引用本文： | 张华,府伟灵,黄庆,郭颖. 重亚硫酸盐修饰直接测序技术检测p16基因甲基化的研究[J]. 重庆医学, 2006, 35(3): 222-223 |
| 作者姓名： | 张华 府伟灵 黄庆 郭颖 |
| 作者单位： | 1. 贵州省人民医院检验科,550000 2. 第三军医大学西南医院检验科,重庆,400038 |
| 摘 要： | 目的建立稳定的重亚硫酸盐直接测序技术，检测p16基因甲基化状况。方法提取正常人全血基因组DNA．建立起稳定的重亚硫酸盐直接测序平台，利用该技术检测结直肠癌细胞株pl6基因甲基化状况。结果应用列联表的Fisher，Exact Test比较3种纯化方法的测序结果，乙醇／醋酸钠和过柱纯化与SAP—ExonI纯化法比较，测序结果差异有统计学意义（P〈0．05）；应用重亚硫酸盐直接测序技术，可检测出p16基因目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况。结论应用SAP—ExonI纯化法，建立了稳定的重亚硫酸盐直接测序技术，并可检测出目的片段中CpG岛所有CpG位点的甲基化状况。 |
| 关 键 词： | 双脱氧测序法 虾碱性磷酸酶(SAP) 核酸外切酶I(EXONI) 测序图谱 |
| 文章编号： | 1671-8348(2006)03-0222-02 |
Methylation detection of p16 gene using directed PCR product sequencing |
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| ZHANG Hua,FU Wei-ling,HUANG Qing,et al.. Methylation detection of p16 gene using directed PCR product sequencing[J]. Chongqing Medical Journal, 2006, 35(3): 222-223 | |
| Authors: | ZHANG Hua FU Wei-ling HUANG Qing et al. |
| Abstract: | Objective To construct method of bisulfite-modification directed PCR product sequencing,and to identify methylation of p16 gene.Methods Ten PCR samples were purified by spin-column,ethanol/ sodium acetate and SAP-ExonI.Results The sequencing results of SAP-ExonI purification method were better than those of the other two methods significantly(P<0.05).Conclusion Satisfactory results can be got when use SAP-ExonI purification method. |
| Keywords: | sanger dideoxy DNA sequencing sequencing chromatogram EXON I(exonuclease I) SAP(shrimp alkaline phosphatase) |
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