| NCOA2促进急性B淋巴细胞白血病细胞增殖及下游信号通路的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张国君,张欢,陈念慈,张彩霞,魏雪婷,刘卓刚. NCOA2促进急性B淋巴细胞白血病细胞增殖及下游信号通路的生物信息学分析[J]. 解剖科学进展, 2019, 25(4): 368-372 |
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| 作者姓名： | 张国君 张欢 陈念慈 张彩霞 魏雪婷 刘卓刚 |
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| 作者单位： | 中国医科大学附属盛京医院第一血液内科,沈阳辽宁,110022;中国医科大学附属盛京医院第一血液内科,沈阳辽宁,110022;中国医科大学附属盛京医院第一血液内科,沈阳辽宁,110022;中国医科大学附属盛京医院第一血液内科,沈阳辽宁,110022;中国医科大学附属盛京医院第一血液内科,沈阳辽宁,110022;中国医科大学附属盛京医院第一血液内科,沈阳辽宁,110022 |
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| 基金项目： | 沈阳市科技厅科学计划项目 |
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| 摘 要： | 目的探讨核受体辅激活因子2(Nuclear Receptor Coactivator 2,NCOA2)在急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)细胞增殖中的作用,并利用生物信息学方法探究NCOA2促进B-ALL细胞增殖涉及的基因和信号通路。方法在B-ALL细胞Nalm6及BALL-1中使用siRNA技术敲减NCOA2,通过Western blot检测NCOA2的敲除效率,通过EdU方法检测Nalm6及BALL-1细胞的增殖能力变化;使用GEO2R软件分析NCOA2敲减细胞系的表达谱数据(GSE118992),找到有意义的差异基因;使用DAVID和KOBAS软件对差异基因进行GO和KEGG分析,对差异基因的作用和参与的信号通路进行聚类分析;使用Venny2.1软件对GO和KEGG中参与调控细胞增殖的因子进行并集分析;使用STRING软件分析参与NCOA2调节细胞增殖相关基因之间的相互作用关系。结果 NCOA2 siRNA能够抑制NCOA2蛋白表达和Nalm6及BALL-1细胞的增殖能力,同时筛选出受其调控的差异显著性基因322个,选择排在前十位的生物学功能和信号通路,把其中参与调节细胞增殖的基因取并集,找到受NCOA2调控的参与细胞增殖的4个基因(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),发现它们之间具有相关作用关系。结论 NCOA2调节细胞增殖相关因子(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),参与B淋巴细胞白血病发生发展。
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| 关 键 词： | 急性B淋巴细胞白血病 NCOA2 细胞增殖 生物信息学 |
NCOA2 promoting the proliferation of acute B lymphoblastic leukemia cells and bioinformatics analysis of the downstream signaling pathway |
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