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2a型HCV E1、E2/NS1区基因cDNA的克隆及序列分析
引用本文:封波,吴文漪,陈红松,陈勇,丛旭,魏来.2a型HCV E1、E2/NS1区基因cDNA的克隆及序列分析[J].中华实验和临床病毒学杂志,2003,17(1):28-30.
作者姓名:封波  吴文漪  陈红松  陈勇  丛旭  魏来
作者单位:1. 221002,江苏徐州医学院附属医院传染科
2. 北京大学人民医院,北京大学肝病研究所
3. 221002,江苏徐州医学院附属医院传染科;北京大学人民医院,北京大学肝病研究所
基金项目:国家自然科学基金 (39770 684,30 170 844)
摘    要:目的:了解丙型肝炎病毒(HCV)2a型基因组E1 E2/NS1区序列,为进一步研究HCV包膜蛋白的生物学功能奠定基础。方法:用逆转录套式PCR(RT-nPCR)从江苏省1例丙型肝炎患者血清中扩增出两条分别约770bp、1100bp的片段,分别以限制性内切酶EcoR I、BamH I和EcoR I、Hand Ⅲ双酶切后连入pUC19载体中,转化感受态细胞,经限制性酶切长度多态性分析(RFLP)和PCR法证实为阳性克隆后,用全自动序列分析仪测序。结果:分别测得约770bp、1100bp的核苷酸序列,拼接后得到的完整核苷酸序列及其编码的氨基酸序列分别与HCV-1、HC-C2、HCV-BK、HC-J6、HC-J8相应序列作比较,显示分离株HCV在核苷酸水平上与以上分离株的同源性分别为60.5%、60.1%、59.7%、87.8%、67.5%;在氨基酸水平上的同源性分别为67.3%、66.4%、65.0%、87.8%、79.0%。结论:分离株(HCV-JS)与HC-J6同属2a型,但同源性有一定差异。

关 键 词:肝炎病毒  病毒包膜蛋白质类  序列分析  变异
修稿时间:2002年10月8日

Cloning and sequence analysis of E1,E2/NS1 region of genotype 2a hepatitis C virus genome
FENG Bo ,WU Wen yi,CHEN Hong song,CHEN Yong,CONG Xu,WEI Lai.Cloning and sequence analysis of E1,E2/NS1 region of genotype 2a hepatitis C virus genome[J].Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology,2003,17(1):28-30.
Authors:FENG Bo  WU Wen yi  CHEN Hong song  CHEN Yong  CONG Xu  WEI Lai
Institution:Affiliated Hospital of Xuzhou Medical College, Jiangsu 221002 China.
Abstract:
Keywords:Hepacivirus  Viral Envelope Proteins  Sequence Analysis  Variation (Genetics)
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