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豆蔻属药用植物DNA条形码鉴定研究
作者姓名:石林春  宋经元  陈士林  姚辉  韩建萍
作者单位:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 北京 100193
基金项目:教育部博士点新教师基金(200800231066):姜科药用植物DNA序列数据库构建及鉴定研究,负责人:韩建萍。
摘    要:目的:针对鉴定十分困难的豆蔻属药用植物筛选适合其鉴定的DNA条形码序列,探索豆蔻属药用植物鉴定新方法。方法:对该属植物36个物种,46个样本的8个候选条形码序列(psbA- trnH, matK, rbcL, psbK-psbI, rpoB, atpB-rbcL, ITS, ITS2)进行PCR扩增、测序和序列分析,我们采用了4种方法对于数据进行分析,应用Mega4.1计算不同序列的种间和种内遗传距离(K-2P);用Wilcoxon秩和检验比较不同序列的变异性;用Taxon DNA软件评估“Barcoding Gap”;用Blast、Distance方法检验物种鉴定的可靠性。结果:ITS2和ITS序列变异显著,物种水平鉴定成功率达100%,其它6个候选序列(psbA-trnH, matK, rbcL, psbK-psbI, rpoB, atpB-rbcL)不能有效鉴定豆蔻属物种。结论:本文推荐将ITS2和ITS作为豆蔻属药用植物潜在的DNA条形码序列,并依此建立该属药用植物的DNA条形码鉴定方法。

关 键 词:豆蔻属 DNA条形码 鉴定
收稿时间:2010-06-04
修稿时间:2010-06-13
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