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2009年至2011年新甲型H1N1流感病毒HA基因同源性比较与进化分析
引用本文:邹伟华,崔大伟,吴英萍,郑书发,何丽,许世佳,余斐,秦志梅,李游江,陈凌晓,陈瑜. 2009年至2011年新甲型H1N1流感病毒HA基因同源性比较与进化分析[J]. 浙江中医药大学学报, 2011, 35(3): 318-321
作者姓名:邹伟华  崔大伟  吴英萍  郑书发  何丽  许世佳  余斐  秦志梅  李游江  陈凌晓  陈瑜
作者单位:1. 温州医学院,温州,325000
2. 浙江大学医学院附属第一医院
3. 温州医学院,温州325000;浙江大学医学院附属第一医院
基金项目:"十一五"国家科技重大专项
摘    要:[目的]分析杭州市2009年1月至2011年1月新甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)的基因序列,探讨该病毒的遗传变异和分子特性。[方法]应用RT-PCR的方法从临床标本中扩增新甲型H1N1流感病毒HA基因片段并测序。利用DNAMAN和Sequencher4.7软件对HA基因序列进行分析,比较HA基因氨基酸亲缘系数并绘制进化树。[结果]成功地对15例新甲型H1N1病毒的HA基因进行扩增并测序,2009年1月至2011年1月新甲型H1N1流感病毒的HA基因的氨基酸序列与参考株具有高度的同源性,其亲缘系数为98.9%~100%,且HA基因氨基酸序列发生了一定的变异。[结论]2009年至2011年新甲型H1N1流感病毒的基因组HA序列与我国和其他国家的新甲型H1N1流感病毒具有高度的同源性,但HA基因的氨基酸序列发生了变异,可能与患者的病情有关,因此需密切关注新甲型H1N1流感病毒的流行情况。

关 键 词:流感病毒  新甲型H1N1  血凝素  神经氨酸酶

Analysis of Homology and Evolution of HA Gene of 2009-2011 Novel Influenza (H1N1) Viruses
Zou Weihua,Cui Dawei,Wu Yingping,et al.. Analysis of Homology and Evolution of HA Gene of 2009-2011 Novel Influenza (H1N1) Viruses[J]. Journal of Zhejiang University of Traditional Chinese Medicine, 2011, 35(3): 318-321
Authors:Zou Weihua  Cui Dawei  Wu Yingping  et al.
Affiliation:Zou Weihua1,Cui Dawei2,Wu Yingping2,et al 1.Wenzhou Medical College,Zhejiang(325025),2.First Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University
Abstract:[Objective] To analyse the genome sequence of Hemagglutinin(HA) of the novel influenza A(H1N1) virus in Hangzhou from 2009 to 2011,and to investigate viral genetic characteristics and evolution status.[Methods] HA gene was amplified by using RT-PCR,the amplified products with expected size were submitted to direct sequencing.All the sequencing results were spliced with the software of DNAMAN and Sequencher 4.7.Alignments of HA gene together with corresponding sequences from all over the world were conducted...
Keywords:influenza  novel Influenza A(H1NI)  hemagglutinin  homology  
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