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| 幽门螺杆菌耐药相关基因突变检测芯片的建立 | |
| 引用本文： | 方静,柴海娜,徐磊,郭一,沈晓莹,张小燕,申媛媛,李航,盛海辉,杨长青,郜恒骏. 幽门螺杆菌耐药相关基因突变检测芯片的建立[J]. 胃肠病学, 2011, 16(9): 539-543. DOI: 10.3969/j.issn.1008-7125.2011.09.007 |
| 作者姓名： | 方静 柴海娜 徐磊 郭一 沈晓莹 张小燕 申媛媛 李航 盛海辉 杨长青 郜恒骏 |
| 作者单位： | 1. 同济大学医学院再生医学系,200092;生物芯片上海国家工程研究中心 2. 生物芯片上海国家工程研究中心;同济大学附属同济医院消化内科,消化疾病研究所 3. 同济大学医学院再生医学系,200092 4. 生物芯片上海国家工程研究中心 5. 同济大学附属同济医院消化内科,消化疾病研究所 |
| 基金项目： | 上海市青年科技启明星计划项目资助 |
| 摘 要： | 幽门螺杆菌（H.pylori）感染与慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌之间的相关性已得到确认.H.pylori对抗生素耐药是导致根除治疗失败的主要原因.目的：建立H.pylori耐药相关基因突变检测芯片,用于指导临床个体化治疗.方法：根据文献数据筛选出7个与根除治疗常用抗生素（克拉霉素、甲硝唑阿莫西林、喹诺酮类、四环素、呋喃唑酮）耐药相关的基因及其单核苷酸多态性（SNP）位点,优化芯片探针设计和反应条件,采用多重PCR技术联合所建立的芯片,检测25例胃黏膜样本的H.pylori耐药相关基因突变情况.测序验证芯片检测结果.结果：25例H.pylori阳性胃黏膜样本的芯片检测结果均与测序结果相符.包括DNA抽提、多重PCR、芯片杂交、数据分析等在内的整个检测流程仅需6h,且重复性和灵敏度十分理想.结论：H.pylori耐药相关基因突变检测芯片能快速、平行、高通量地检测H.pylori耐药相关突变位点,结果准确、可靠. |
| 关 键 词： | 螺杆菌,幽门 抗生素 抗药性 突变 微阵列分析 |
Development of Oligonucleotide Microarray for Detection of Mutations Associated with Antibiotic Resistance of Helicobacter pylori |
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| FANG Jing,CHAI Haina,XU Lei,GUO Yi,SHEN Xiaoying,ZHANG Xiaoyan,SHEN Yuanyuan,LI Hang,SHENG Haihui,YANG Changqing,GAO Hengjun. Development of Oligonucleotide Microarray for Detection of Mutations Associated with Antibiotic Resistance of Helicobacter pylori[J]. Chinese Journal of Gastroenterology, 2011, 16(9): 539-543. DOI: 10.3969/j.issn.1008-7125.2011.09.007 | |
| Authors: | FANG Jing CHAI Haina XU Lei GUO Yi SHEN Xiaoying ZHANG Xiaoyan SHEN Yuanyuan LI Hang SHENG Haihui YANG Changqing GAO Hengjun |
| Affiliation: | FANG Jing,CHAI Haina,XU Lei,GUO Yi,SHEN Xiaoying,ZHANG Xiaoyan,SHEN Yuanyuan,LI Hang,SHENG Haihui,YANG Chongqing,GAO Hengjun.Department of Regenerative Medicine,Tongji University School of Medicine,Shanghai(200092) |
| Abstract: | Helicobacter pylori(H.pylori) infection is linked to the development of chronic gastritis,peptic ulcer and even gastric cancer.Resistance of H.pylori to antibiotics is the major cause of eradication failure.Aims:To develop an oligonucleotide microarray for detection of mutations associated with antibiotic resistance of H.pylori that can be used to guide the individualized treatment in clinical practice.Methods:Seven genes associated with antibiotic resistance of H.pylori,including clarithromycin,metronidazo... |
| Keywords: | Helicobacter pylori Antibiotics Drug Resistance Mutation Microarray Analysis |
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