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PFGE与MLVA在福建地区肠炎沙门菌分子分型中的应用与评价北大核心CSCD
作者姓名:黄梦颖  陈建辉  杨劲松  罗朝晨  徐海滨  李曲文  邱玉锋
作者单位:1.福建省疾病预防控制中心350001;2.福建省人兽共患病研究重点实验室;
基金项目:福建省卫生健康科研人才培养项目(No.2019-2-16);福建省卫计委青年课题(No.2017/1/21);福建省科技创新平台建设项目(No.2019Y2001)。
摘    要:目的比较和评价脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)和多位点可变数目串联重复序列分析技术(MLVA)在福建地区肠炎沙门菌分子分型中的应用价值。方法采用PFGE和MLVA技术对福建地区88株肠炎沙门菌分离株进行分子分型,结合流行病学资料分析比较分型效果。结果88株肠炎沙门菌经PFGE分型后,相似度系数为43.9%~100.0%,得到46个PFGE型别(PT 0001~PT 0046)、2个优势型别簇(cluster A~B),分辨系数(D值)为0.9459。PT 0002、PT 0011、PT 0013和PT 0029为优势PFGE;经MLVA分型后,遗传关联度介于26.8%~100%之间,得到40个MLVA型别(MT 0001~MT 0040)、2个优势基因簇(cluster 1~2),分辨系数(D值)为0.9235。MT 0005、MT 0004和MT 0014为优势MLVA型别。结论PFGE分辨力略高,与流行病学背景资料更吻合;MLVA在分析菌株之间亲缘关系和遗传相关性方面更具优势。

关 键 词:肠炎沙门菌  PFGE  MLVA  分子分型
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