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1p36 deletion syndrome: Review and mapping with further characterization of the phenotype,a new cohort of 86 patients
Authors:Clémence Jacquin  Emilie Landais  Céline Poirsier  Alexandra Afenjar  Ahmad Akhavi  Nathalie Bednarek  Caroline Bénech  Adeline Bonnard  Damien Bosquet  Lydie Burglen  Patrick Callier  Sandra Chantot-Bastaraud  Christine Coubes  Charles Coutton  Bruno Delobel  Margaux Descharmes  Jean-Michel Dupont  Vincent Gatinois  Nicolas Gruchy  Sarah Guterman  Abdelkader Heddar  Lucas Herissant  Delphine Heron  Bertrand Isidor  Pauline Jaeger  Guillaume Jouret  Boris Keren  Paul Kuentz  Cedric Le Caignec  Jonathan Levy  Nathalie Lopez  Zoe Manssens  Dominique Martin-Coignard  Isabelle Marey  Cyril Mignot  Chantal Missirian  Céline Pebrel-Richard  Lucile Pinson  Jacques Puechberty  Sylvia Redon  Damien Sanlaville  Marta Spodenkiewicz  Anne-Claude Tabet  Alain Verloes  Gaelle Vieville  Catherine Yardin  François Vialard  Martine Doco-Fenzy
Affiliation:1. Service de Génétique, CRMR AnDDI-Rares, CHU Reims, Reims, France;2. Centre de Référence des Malformations et Maladies Congénitales du Cervelet, Département de Génétique et Embryologie Médicale, APHP, Hôpital Trousseau, Paris, France;3. Cardiologie pédiatrique et congénitale, CHU Reims, Reims, France;4. Service de pédiatrie, Pôle Femme Parents Enfants, CHU Reims, Reims, France

CReSTIC/EA 3804, URCA, Reims, France;5. University of Brest, Inserm, EFS, UMR 1078, GGB, Brest, France;6. Département de Génétique, Hôpital Robert Debré, Paris, France;7. Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France;8. Laboratoire de Cytogénétique, CHU Dijon, Dijon, France;9. AP-HP Sorbonne Université, Département de Génétique Médicale, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France;10. Département de Génétique Médicale, Maladies Rares et Médecine Personnalisée, Génétique clinique, CHU Montpellier, Université Montpellier, Centre de référence anomalies du développement SOOR, Montpellier, France;11. Département de Génétique et Procréation, Hôpital Couple Enfant, CHU Grenoble-Alpes, Grenoble, France

Genetic Epigenetic and Therapies of Infertility team, Institute for Advanced Biosciences, Inserm U 1209, CNRS UMR 5309, Université Grenoble Alpes, Grenoble, France;12. Centre de Génétique Chromosomique, GH de l'Institut Catholique de Lille-Hopital Saint Vincent de Paul, Lille, France;13. Service de pédiatrie, Pôle Femme Parents Enfants, CHU Reims, Reims, France;14. Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle, APHP. Centre-Université Paris Cité site Cochin, Paris, France;15. Plateforme ChromoStem, Unité de génétique chromosomique, Département de génétique moléculaire et cytogénomique, CHU de Montpellier, Université de Montpellier, Montpellier, France;16. Service de Génétique, CHU Caen, Université Caen Normandie, Caen, France;17. Département de Génétique, Centre Hospitalier Intercommunal Poissy-St-Germain-en-Laye, Poissy, France;18. AP-HP Sorbonne Université, Département de Génétique Médicale, Hôpital Armand Trousseau, Paris, France

Département de Génétique;19. Centre de Référence Déficience Intellectuelle de Causes Rares, APHP Sorbonne Université, GH Pitié-Salpêtrière, Paris, France;20. Service de Génétique Médicale, CHU de Nantes, Nantes, France;21. National Center of Genetics, Laboratoire National de Santé, Dudelange, Luxembourg;22. Département de Génétique;23. Oncobiologie Génétique Bioinformatique, CHU de Besançon, Besançon, France;24. Service de neuropédiatrie, Hôpital Armand Trousseau, Groupe Hospitalier Universitaire de l'Est Parisien, Paris, France;25. Service de génétique médicale, CH du Mans, Le Mans, France;26. Département de Génétique et Procréation, Hôpital Couple Enfant, CHU Grenoble-Alpes, Grenoble, France;27. Laboratoire de Génétique Chromosomique, Département de Génétique Médicale, AP- HM, Marseille, France;28. Service de Cytogénétique Médicale, CHU de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand, France;29. University of Brest, Inserm, EFS, UMR 1078, GGB, Brest, France

Service de Génétique Médicale et Biologie de la Reproduction, CHU de Brest, Brest, France;30. Department of Cytogenetics and clinical genetics, Limoges University Hospital, University of Limoges, Limoges, France;31. Département de Génétique, Centre Hospitalier Intercommunal Poissy-St-Germain-en-Laye, Poissy, France

RHuMA, UMR BREED, INRAE-UVSQ-ENVA, Montigny-le-bretonneux, France;32. Service de Génétique, CRMR AnDDI-Rares, CHU Reims, Reims, France

Service de génétique médicale, CHU de Nantes, Nantes, France

L'institut du thorax, INSERM, CNRS, UNIV Nantes, CHU de Nantes, Nantes, France

Abstract:Chromosome 1p36 deletion syndrome (1p36DS) is one of the most common terminal deletion syndromes (incidence between 1/5000 and 1/10,000 live births in the American population), due to a heterozygous deletion of part of the short arm of chromosome 1. The 1p36DS is characterized by typical craniofacial features, developmental delay/intellectual disability, hypotonia, epilepsy, cardiomyopathy/congenital heart defect, brain abnormalities, hearing loss, eyes/vision problem, and short stature. The aim of our study was to (1) evaluate the incidence of the 1p36DS in the French population compared to 22q11.2 deletion syndrome and trisomy 21; (2) review the postnatal phenotype related to microarray data, compared to previously publish prenatal data. Thanks to a collaboration with the ACLF (Association des Cytogénéticiens de Langue Française), we have collected data of 86 patients constituting, to the best of our knowledge, the second-largest cohort of 1p36DS patients in the literature. We estimated an average of at least 10 cases per year in France. 1p36DS seems to be much less frequent than 22q11.2 deletion syndrome and trisomy 21. Patients presented mainly dysmorphism, microcephaly, developmental delay/intellectual disability, hypotonia, epilepsy, brain malformations, behavioral disorders, cardiomyopathy, or cardiovascular malformations and, pre and/or postnatal growth retardation. Cardiac abnormalities, brain malformations, and epilepsy were more frequent in distal deletions, whereas microcephaly was more common in proximal deletions. Mapping and genotype–phenotype correlation allowed us to identify four critical regions responsible for intellectual disability. This study highlights some phenotypic variability, according to the deletion position, and helps to refine the phenotype of 1p36DS, allowing improved management and follow-up of patients.
Keywords:1p36 deletion syndrome  chromosomal deletion  genotype–phenotype correlation  monosomy 1p36
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