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基于铁死亡相关基因构建头颈部鳞状细胞癌的预后预测模型并验证
引用本文:贺晴,曹晓林,韩弈垣,刘翰林.基于铁死亡相关基因构建头颈部鳞状细胞癌的预后预测模型并验证[J].医学研究杂志,2023,52(4):64-68.
作者姓名:贺晴  曹晓林  韩弈垣  刘翰林
作者单位:浙江中医药大学第四临床医学院 杭州,310053;浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院耳鼻咽喉头颈外科 310006
基金项目:浙江省医药卫生科技计划项目(2015KYB284)
摘    要:目的 构建基于铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes, FRGs)的头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)预后预测模型并验证。方法 从TCGA和GEO数据库下载HNSCC RNA-seq数据及相关临床数据,分别作为训练队列和验证队列。从FerrDb网站提取共259个FRGs。利用单因素COX回归分析在训练队列中筛选与HNSCC患者预后有关的FRGs(P<0.01)。利用Lasso COX回归分析构建预后预测模型,并根据风险评分公式计算各临床样本的风险系数,然后使用Kaplan-Meier生存曲线和时间依赖性受试者操作特征(time-dependent receiver operating characteristic, time ROC)曲线评估该模型效能。同理,验证该模型在验证队列中的可行性和可重复性。最后采用单因素及多因素COX回归分析对该预后预测模型进行独立预后分析。结果 训练队列中与HNSCC患者预后显著相关的FRGs共有12个,在此基础之上利用Lasso COX回归算法构建...

关 键 词:头颈部鳞状细胞癌  铁死亡相关基因  TCGA  GEO  预后模型
收稿时间:2022/5/13 0:00:00
修稿时间:2022/5/23 0:00:00
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