| 辽宁省甲3亚型流感病毒HAl基因特性分析 |
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| 引用本文： | 吴少慧,舒跃龙,赵卓,姚文清,于伟,张眉眉,崔健秋,刘敏,付荣华,赵晓光. 辽宁省甲3亚型流感病毒HAl基因特性分析[J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2009, 23(3). DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2009.03.005 |
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| 作者姓名： | 吴少慧 舒跃龙 赵卓 姚文清 于伟 张眉眉 崔健秋 刘敏 付荣华 赵晓光 |
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| 作者单位： | 1. 辽宁省疾病预防控制中心传染与感染性疾病控制所,沈阳,10005
2. 中国疾病预防控制中心病毒病所 |
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| 基金项目： | 人事部留学回国人员博士后科研启动基金，教育部留学回国人员科研启动基金 |
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| 摘 要： | 目的 了解2001-2006年间辽宁省甲3亚型流感病毒HAl基因变异特征.方法 采用辽宁省流感监测的咽拭分离株,对其中的7株甲3病毒核酸提取,经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),扩增产物测序,推导出其氨基酸序列,并用DNA MAN软件包中的Alignment做了差异和同源性比较,用Mega软件包中的Neighbor Joining方法 ,通过与NCBI数据库中2000-2006年28株H3N2流感病毒同源比对后,制作种系进化树,进行基因进化特征分析.结果 序列分析发现,甲3亚型流感病毒与WHO当年的疫苗株M/California/7/2004比较,在其HA1核酸序列上有12处碱基不同,4个氨基酸位点发生了替换.基因及氨基酸序列同源性下降.与WHO北半球疫苗株A/Wisconsirn/67/2005序列更接近,但仍有4处碱基不同.结论 甲3亚型流感病毒基因序列发生了变异,与甲3亚型疫苗株A/California/7/2004同源性有下降趋势,提示其抗原可能发生部分漂移或更换,与南方浙江2005年株、WHO北半球2006-2007疫苗株A/Wiseonsin/6712005序列接近,提示南方春夏季流感流行株极有可能在北方秋冬季流行,对流感流行病学监测,疫苗株使用指导都具有重要意义.
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| 关 键 词： | 正粘病毒科 基因,HA1 序列分析 |
An analysis on genetic characterization of HA1 gene of influenza virus subtype H3N2 circulated from 2001 to 2006 in Liaoning local area |
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| WU Shao-hui,SHU Yue-long,ZHAO Zhuo,YAO Wen-qing,YU Wei,ZHANG Mei-mei,CUI Jian-qiu,LIU Min,FU Rong-hua,ZHAO Xiao-guang. An analysis on genetic characterization of HA1 gene of influenza virus subtype H3N2 circulated from 2001 to 2006 in Liaoning local area[J]. Chinese journal of experimental and clinical virology, 2009, 23(3). DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2009.03.005 |
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| Authors: | WU Shao-hui SHU Yue-long ZHAO Zhuo YAO Wen-qing YU Wei ZHANG Mei-mei CUI Jian-qiu LIU Min FU Rong-hua ZHAO Xiao-guang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Orthomyxoviridae Genes HA1 Sequence analysis |
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