非小细胞肺癌细胞A549顺铂耐药潜在机制的全转录组测序分析 |
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引用本文: | 倪耀军,徐忠能,陈胜,王俊.非小细胞肺癌细胞A549顺铂耐药潜在机制的全转录组测序分析[J].中国胸心血管外科临床杂志,2021(1). |
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作者姓名: | 倪耀军 徐忠能 陈胜 王俊 |
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作者单位: | 南京医科大学附属淮安第一医院胸外科;南京医科大学第一附属医院胸外科 |
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基金项目: | 江苏省卫生健康委医学科研项重点项目(K2019002);江苏省社会发展临床前沿技术基金项目(BE2018746)。 |
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摘 要: | 目的通过全转录组测序分析比较野生型A549细胞和顺铂耐药A549细胞(A549/DPP)表达谱的差别,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药潜在机制。方法首先建立A549/DDP细胞系,对A549和A549/DDP进行全转录组测序,分别对lnc RNA-seq,circ RNA-seq和mi RNA-seq数据进行差异表达以及功能富集分析(KEGG和GO分析)。然后进行全转录组数据联合分析以及ce RNA网络的构建。结果与A549细胞系相比,其中4517个lnc RNA、123个circ RNA以及145个mi RNA在A549/DDP细胞中有差异表达。显著富集在与癌症相关的通路上。mi RNA-circ RNA-lnc RNA-m RNA四元网络包含了12个mi RNA,4个circ RNA,23个lnc RNA和9个m RNA节点。经过拓扑学性质分析hsa-mi R-125a-5p和hsa-mi R-125b-5p是顺铂耐药相关的关键mi RNA。结论肿瘤坏死因子信号通路和p53信号通路参与了A549/DPP耐药机制。Hsa-mi R-125a-5p和hsa-mi R-125b-5p可能是逆转顺铂抗性的潜在靶点。
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关 键 词: | 非小细胞肺癌 顺铂耐药 全转录组测序 ceRNA网络 |
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