| 采用粒子群优化的基因转录差异分析模型 |
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| 引用本文： | 冯伟兴,王科俊. 采用粒子群优化的基因转录差异分析模型[J]. 中国生物医学工程学报, 2010, 29(2). DOI: 10.3969/j.issn.0258-8021.2010.02.012 |
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| 作者姓名： | 冯伟兴 王科俊 |
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| 作者单位： | 哈尔滨工程大学模式识别与智能系统研究所,哈尔滨,150001 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展(863)计划 |
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| 摘 要： | ![]()
高通测序技术可以更加全面地检测实验样本中基因转录水平,这使得对样本间基因转录差异的分析精度越来越准确。根据通过DNA高通测序技术获得的基因转录区内PolⅡ蛋白个数,提出了两个样本间基因转录差异分析模型。该模型在考虑同一基因间转录差异的同时,引入了全基因的转录分布特性以提高模型分析精度。模型采用预测概率最大化统计算法进行参数求取。在概率最大化步骤中,由于难以得到模型参数解析解和提高算法效率,采用粒子群优化算法直接进行求取模型参数数值解。乳腺癌实验数据测试表明,该模型可有效分析不同样本间基因转录差异。
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| 关 键 词： | 基因 转录差异 粒子群 分析模型 |
A Model for Analyzing Gene Transcription Difference Using Particle Swarm Optimization |
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| FENG Wei-Xing WANG Ke-Jun. A Model for Analyzing Gene Transcription Difference Using Particle Swarm Optimization[J]. Chinese Journal of Biomedical Engineering, 2010, 29(2). DOI: 10.3969/j.issn.0258-8021.2010.02.012 |
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| Authors: | FENG Wei-Xing WANG Ke-Jun |
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| Affiliation: | FENG Wei-Xing WANG Ke-Jun(Pattern Recognition , Intelligent System Institute of Harbin Engineering University,Harbin,Heilongjiang 150001,China) |
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| Abstract: | ![]()
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