外泌体ceRNA调控网络与阿尔茨海默病相关性的生物信息学分析

目的：探讨阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease,AD）与外泌体ceRNA 调控网络之间的潜在关系,为临 床治疗及研究靶点提供基础。方法：在基因表达综合数据库（gene expression omnibus,GEO）中下载数据,筛选 AD 患者和健康对照之间的差异基因（differentially expressed genes,DEGs）和差异microRNAs（miRNAs）,确 定AD 的生物标志物。利用DAVID 对DEGs 进行基因本体论（gene ontology,GO）功能富集分析,用KEGG 对 DEGs 进行信号通路分析,利用cytoscape 对DEGs 和靶向miRNAs 进行作用分析并找出关键节点。结果：筛选 到683 个DEGs（377 个下调的DEGs 和306 个上调的DEGs）,并筛选了90 个与AD 相关的富集于外泌体和细 胞囊泡的DEGs 作为我们的目标DEGs。本项目还筛选了748 个差异表达的miRNAs（90 个下调的miRNAs 和 658 个上调的miRNAs）,并筛选出186 个细胞外囊泡miRNAs（147 个上调的miRNAs 和39 个下调的miRNAs）。 利用数据库预测了这些miRNAs 与目标DEGs 之间的靶向关系、lncRNA 与miRNA 之间的靶向关系、circRNA 与miRNA 之间的靶向关系,构建了lncRNA-miRNA-mRNA 和circRNA-miRNA-mRNA ceRNA 调控网络, 重点探讨了部分结果在AD 疾病中的重要作用。结论：这些结果表明,AD 的发生是多个相互作用的基因和 非编码RNA 协同作用的结果。本项目数据的挖掘为AD 相关的外泌体ceRNA 网络提供了一个新的视角和 解析。