| 细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-00512的生物信息学分析北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 李莎莎,陶佳,吕咏雪,朱亚洲,赵殷奇,赵嘉庆,赵巍.细粒棘球绦虫原头节抗原Eg-00512的生物信息学分析北大核心CSCD[J].中国病原生物学杂志,2022(1):71-74. |
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| 作者姓名： | 李莎莎 陶佳 吕咏雪 朱亚洲 赵殷奇 赵嘉庆 赵巍 |
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| 作者单位： | 1.宁夏医科大学基础医学院750004;2.宁夏医科大学总医院;;3.宁夏常见传染病防治重点实验室;;4.宁夏医学科学研究所; |
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| 基金项目： | 宁夏回族自治区重点研发计划项目(No.2019BCG01001)；宁夏自然科学基金项目(No.2020AAC02039)。 |
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| 摘 要： | 目的分析细粒棘球绦虫原头节特异性抗原Eg-00512的生物信息学特征。方法通过NCBI数据库获取Eg-00512蛋白的氨基酸序列;使用ProtParam在线软件分析Eg-00512蛋白的理化性质;采用SOMPA在线软件分析蛋白的二级结构;使用IEDB在线软件预测Eg-00512蛋白的亲水性、柔韧性、表面可及性、β-转角;应用SWISS-MODEL在线服务器分析蛋白氨基酸序列并组合模板和Eg-00512蛋白的三级结构;B细胞表位采用在线软件IEDB及BcePred综合预测,T细胞表位采用在线预测软件SYFPEITHI分析确定。结果Eg-00512蛋白由1254个氨基酸组成,理论pI值6.15;归类于稳定蛋白质,属于亲水性蛋白。Eg-00512蛋白的二级结构中α螺旋占51.28%,延伸链占17.22%,β-转角占4.78%,无规卷曲占26.71%。Eg-00512蛋白B细胞表位数量各为8个;有13个CTL和14个Th细胞优势表位。结论生物信息学方法预测细粒棘球绦虫原头节含有多个优势B、T细胞抗原表位,为包虫病的诊断和疫苗的研究奠定了理论基础。
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| 关 键 词： | 细粒棘球绦虫 Eg-00512蛋白 生物信息学分析 抗原表位 |
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