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北京市同性恋HIV-1感染者的包膜基因C2-V3区序列测定和亚型分析
引用本文:姚均,张福杰,何忠平,赵红心,李兴旺,冯鑫,徐克沂. 北京市同性恋HIV-1感染者的包膜基因C2-V3区序列测定和亚型分析[J]. 中国艾滋病性病, 2002, 8(3): 131-133
作者姓名:姚均  张福杰  何忠平  赵红心  李兴旺  冯鑫  徐克沂
作者单位:1. 北京地坛医院艾滋病临床研究中心,100011
2. 卫生部艾滋病预防和控制中心
基金项目:首都医学发展科研基金资助(基金编号:ZD199914)
摘    要:
目的 了解北京市同性恋HIV-1感染者HIV-1的亚型类型及传播来源和流行时间。方法 应用套式聚合酶链式反应(PCR)对12份1993~2001年北京市HIV-1阳性同性恋者外周血单个核细胞(PBMC)的核酸样品进行扩增,并对其包膜区的C2-V3段的306个核酸序列进行测定和分析。结果12份样品全部是B亚型的HIV-1毒株序列,其亚型内的基因离散率为 10.35± 2.06,与国际 A-E亚型共享序列比较后发现其与 A、C、D、E亚型的共享序列的基因离散率均大于 25%,而与国际 B亚型共享序列的基因离散率仅为11.25±3.60。系统树分析显示,12个毒株与B亚型共享序列聚在一起并远离其它国际亚型,并且12个毒株与SF162紧密相连,而与国际B亚型共享序列和泰国B亚型代表株TH14可以分开。对gp120中最重要的中和抗体决定簇V3环序列进行对比分析发现,12毒株在V3环中变化较大,其中4毒株带有GPGR这一欧美B亚型V3环顶端四肽序列特征,占33.33%,1个毒株带有GLGR,占8.33%,而其它7个毒株为GWGR,占58.34%。结论HIV-1在北京市同性恋人群中流行的为B亚型,流行来源为欧美,流行时间10年左右,V3环顶端四肽序列特征以GWGR为主。

关 键 词:HIV-1  亚型  基因变异  序列测定
修稿时间:2002-03-06

Subtype and sequence analysis of the C2-V3 region of env gene among HIV-1 infected homosexual men in Beijing
Yao Jun,Zhang Fujie,He Zhangping,et al.. Subtype and sequence analysis of the C2-V3 region of env gene among HIV-1 infected homosexual men in Beijing[J]. Chinese JOurnal of Aids & STD, 2002, 8(3): 131-133
Authors:Yao Jun  Zhang Fujie  He Zhangping  et al.
Affiliation:Yao Jun,Zhang Fujie,He Zhangping,et al. Beijing Ditan Hospital,Beijing 100011,P. R . China
Abstract:
Keywords:HIV-1 Gene variation Sequencing
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