摘 要: | 目的 运用生物信息学方法筛选子宫内膜异位症的差异表达基因,系统探讨子宫内膜异位症的病因病理机制。方法 通过GEO数据库搜索子宫内膜异位症基因芯片,联合Perl语言及R语言分析异位子宫内膜组织与正常组织的差异表达基因;利用STRING数据库及Cytoscape软件绘制PPI网络图;通过g:profiler数据库对关键差异基因进行GO和KEGG富集分析。结果 共纳入2套子宫内膜异位症基因芯片,筛选出共同差异表达基因308个(178个上调,130个下调),剔除degree值为1和2的基因后得到关键差异表达基因170个(上调91个,下调79个),其中差异最显著的基因为:TAGLN(上调)、EpCAM(下调);PPI网络图中得到degree值最大的差异基因为:CDK1。差异表达基因GO生物过程富集分析得出细胞周期改变、细胞黏附、增殖异常等与EMs发生发展密切相关,KEGG通路富集分析发现包括ECM受体相互作用通路、局灶性黏着斑、PI3K-Akt信号通路等在内的8条通路参与其中。结论 子宫内膜异位症的病因病理机制可能与TAGLN、EpCAM、CDK1基因表达异常及其涉及的表观遗传修饰改变、上皮-间...
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