摘 要: | 目的 利用公共数据库分析胶质母细胞瘤(GBM)免疫微环境,寻找有效评价GBM免疫微环境的方法,以期提高GBM免疫治疗的有效性和准确判断预后。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)网站下载GBM患者的临床信息、转录组数据和基因突变数据。单样本基因富集分析评估免疫细胞浸润程度;K-means法样本聚类;“limma”包计算差异基因;主成分分析法进行免疫浸润细胞(ICI)打分;“ggpubr”和“reshape”R包分析患者肿瘤突变负荷(TMB)与ICI之间相关性;“Survival”包绘制K-M生存曲线;“clusterProfiler”R包做基因GO富集分析;使用Java GESA software(version 4.1.0)和“h.all.v7.2.symbols.gmt”作为参考基因集进行基因功能富集分析。结果 GBM样本可聚类分为5种免疫亚型(A-E);免疫得分与患者生存时间相关,高、低免疫得分组患者间生存时间存在明显差异(P<0.01),ICI高打分组生存时间明显较长;TMB与ICI无相关性,但低TBM-低ICI患者生存最差;高、低ICI组的基因富集情况不同。结论 GBM患者...
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