| 不同居群草珊瑚的ITS序列分析及模式识别研究 |
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| 引用本文： | 魏艺聪,陈莹,牛广俊,罗林泉,杨群雄,陈艺娟,梁一池. 不同居群草珊瑚的ITS序列分析及模式识别研究[J]. 中草药, 2014, 45(20): 2982-2986 |
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| 作者姓名： | 魏艺聪 陈莹 牛广俊 罗林泉 杨群雄 陈艺娟 梁一池 |
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| 作者单位： | 福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122;福建农林大学园林学院, 福建 福州 350002;福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122;福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122;福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122;福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122;福建中医药大学药学院, 福建 福州 350122 |
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| 基金项目： | 福建省教育厅A类项目（JA11138）；福建省科技重大项目（2011Y4005） |
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| 摘 要： | 目的 通过分析不同居群草珊瑚Sarcandra glabra和金粟兰属5种近缘植物的核糖体基因内部转录间隔区(rDNA-ITS)序列,为草珊瑚鉴定和品种鉴别提供模式识别与思路。方法 采集不同产地的草珊瑚18份、金粟兰6份,所有样品提取总DNA,并对其ITS片段进行扩增、测序,并搜索GenBank数据库中收录的其他4种金粟兰属植物的ITS序列,运用ClustalX 2.1软件比较不同产地草珊瑚与其他金粟兰属植物的ITS序列差异,并对其进行聚类分析。结果 草珊瑚样品不同居群间的ITS序列相似度达99%,其中位点总突变率ITS1(2.7%)>ITS2(1.4%),而与金粟兰属其他植物相比,位点总突变率ITS2(20.3%~22.7%)>ITS1(15.9%~18.3%)。聚类分析表明18个不同种群的草珊瑚居群间变异极小,且与金粟兰属5种近缘植物具有显著差异的聚类识别。结论 草珊瑚ITS1与ITS2分别为不同居群间及与不同属近缘植物间比较有效的鉴别序列,具有较多个特异性信息位点的草珊瑚ITS序列用于鉴别金粟兰属5种近缘植物,具显著差异的聚类识别,是草珊瑚和金粟兰属近缘植物鉴定和品种鉴别的有效分子标记。
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| 关 键 词： | 草珊瑚 金粟兰 ITS序列 品种鉴别 聚类分析 |
| 收稿时间： | 2014-06-11 |
Sequences analysis and pattern recognition of ITS in Sarcandra glabra from different areas |
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| WEI Yi-cong,CHEN Ying,Niu Guang-jun,LUO Lin-quan,YANG Qun-xiong,CHEN Yi-juan and LIANG Yi-chi. Sequences analysis and pattern recognition of ITS in Sarcandra glabra from different areas[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2014, 45(20): 2982-2986 |
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| Authors: | WEI Yi-cong CHEN Ying Niu Guang-jun LUO Lin-quan YANG Qun-xiong CHEN Yi-juan LIANG Yi-chi |
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| Affiliation: | College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China;College of Landscape Architecture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fouzhou 350002, China;College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China;College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China;College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China;College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China;College of Pharmacy, Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou 350122, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sarcandra glabra (Thunb.) Nakai Chloranthus spicatus (Thunb.) Makino ITS sequence species identification cluster analysis |
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