摘 要: | 目的:通过生物信息学分析筛选出骨肉瘤转移的关键基因,探讨骨肉瘤转移潜在的机制和关键标志物。方法:从TARGET数据库中下载骨肉瘤基因表达谱和临床信息数据,采用R软件的“limma”包筛选骨肉瘤转移组和非转移组的差异基因(Difference genes, DEGs),对差异基因运用R软件的“clusterProfiler”包进行基因本体论(Gene Ontology, GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)分析,了解DEGs富集的分子功能及通路,采用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(Protein-Protein inter-action network, PPI)网络,采用Cytoscape软件对DEGs进行相关性分析,找出与骨肉瘤转移进展最相关的核心基因(Hub gene);对Hub基因进行Kaplan-Meier(K-M)生存分析,明确和验证Hub基因与骨肉瘤患者预后之间的关系,筛选出对预后具有意义的关键基因。结果:分析出248个有差异表达的基因,其中上调18个、下调230个差异基因,...
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