从热休克因子1基因敲除小鼠心肌组织中筛选应激反应中受热休克因子1调控的靶基因 |
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作者姓名: | 刘瑛 袁灿 张华莉 肖献忠 |
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作者单位: | 中南大学湘雅医学院病理生理学教研室,湖南省长沙市,410078 |
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摘 要: | 采用cDNA芯片(上海博星公司,含15000个基因)分析了热休克因子1(HSF)基因敲除小鼠经热休克反应(42℃ 15min,恢复3h)后心肌组织中基因表达谱的改变,结果共筛选到差异表达基因1142个,其中在HSF^-/-小鼠心肌中表达下调的基因为501个,已命名基因为173个;在HSF^-/-小鼠心肌中表达上调的基因为641个,已命名基因为235个。对基因启动子区转录因子结合位点的分析发现,在HSF^-/-小鼠心肌中表达下调2.5倍的基因中,有Klf4和Sdrfl等5个基因启动子区含有完整的热休克元件(heat shock element,HSE);在HSF^-/-小鼠心肌中表达上调2.5倍的基因中,有Neul、Fgl2等6个基因启动子区含有完整的热休克元件,上述结果表明热休克因子1直接调控了这些基因的表达。本研究还采用生物信息学技术成功克隆了人XLHSRF1基因(GenBank ID:AY221994)及其大鼠同源基因。本实验在国际上首次从热休克因子1基因敲除小鼠心肌组织中筛选到应激反应中受热休克因子1调控的多个靶基因,为从基因水平进一步揭示热休克因子1在调节应激反应中的作用提供了新的信息。
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关 键 词: | 病理生理学 热休克因子1 炎症 基因 cDNA芯片技术 热休克因子1基因敲除 心肌 基因表达谱 差异表达基因 |
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