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铜死亡相关基因在肝细胞癌中的表达及其临床意义
作者姓名:孟云  董保龙  董晓骅  彭江山  郭辉军  张旭升  杜雪芹  杨晓军
作者单位:1.甘肃中医药大学第一临床医学院,甘肃 兰州 730000;2.甘肃省人民医院 普通外科,甘肃 兰州 730000;3.兰州大学第一临床医学院,甘肃 兰州 730000;4.甘肃省外科肿瘤分子诊断与精准治疗重点实验室,甘肃 兰州730000;5.甘肃省消化道恶性肿瘤防控工程研究中心,甘肃 兰州 730000
基金项目:甘肃省人民医院国家级科研培育计划重点基金资助项目(19SYPYA-12);甘肃省科技厅创新基地和人才计划基金资助项目(20JR10RA433);甘肃省科技厅科技计划重点研发计划基金资助项目(21YF5WA027);甘肃省卫生健康行业科研计划基金资助项目(GSWSKY2020-45);甘肃省人民医院科技创新青年基金资助项目(21GSSYC-4);甘肃省教育厅优秀研究生“创新之星”基金资助项目(2021CXZX-735)。
摘    要:
背景与目的:肝细胞癌(HCC)是一种全球常见的恶性肿瘤,具有高复发率和高病死率。铜死亡是一种新型的程序性细胞死亡,涉及肿瘤细胞的增殖和生长、血管生成和转移。
因此,本研究探讨铜死亡相关基因(CRGs)在HCC中的表达与预后的关系,并建立预后相关的列线图模型以及分析CRGs与HCC免疫细胞浸润的关系。方法:使用R语言“limma”包对TCGA数据库下载的HCC组织与正常组织的数据中CRGs进行差异表达分析;“clusterProfiler”包进行GO和KEGG分析;单因素Cox回归分析筛选与预后相关的CRGs,LassoCox回归分析构建HCC中CRGs相关预后评分模型;“ggsurvplot”包以总生存(OS)为结局绘制Kaplan-Meier生存曲线;“survival ROC”包绘制ROC曲线评估预后评分的准确性;“regplot”和“rms”包绘制列线图和校准曲线;利用TIMER数据库分析CRGs的表达与6种免疫细胞丰度之间的关系。结果:与正常组织相比,HCC组织19个CRGs中的16个有差异表达(上调:PDHB、PDHA1、MTF1、LIPT1、LIPT2、LIAS、GLS、DL...


关 键 词:癌,肝细胞  铜死亡  预后  列线图  免疫
收稿时间:2022-08-31
修稿时间:2023-01-10
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