| 曼氏迭宫绦虫线粒体载体蛋白结构和功能的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 芦亚君,史大中,钟赛凤,甘秀凤,吕刚.曼氏迭宫绦虫线粒体载体蛋白结构和功能的生物信息学分析[J].海南医学,2013,24(13):1879-1882. |
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| 作者姓名： | 芦亚君 史大中 钟赛凤 甘秀凤 吕刚 |
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| 作者单位： | 海南医学院热带医学与检验医学院病原生物学教研室,海南 海口,571199 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(项目编号：30860070) |
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| 摘 要： | 目的应用生物信息学技术预测曼氏迭宫绦虫线粒体载体蛋白超家族的结构和功能,为进一步研究曼氏迭宫绦虫的蛋白质提供理论依据。方法将测得的曼氏迭宫绦虫成虫EST序列用ORF finder获取开放读码框,Blast进行分析其结构域。应用分析工具Protparam、InterProScan、protscale、SignalP-3.0、PSORTⅡ、BepiPred、TMHMM、VectorNTI Suite 9软件包、Phyre2分别进行该蛋白质的基本性质、结构域、疏水性、信号肽、亚细胞定位、抗原表位、跨膜区及空间结构的预测及分析。结果 Blast预测该蛋白质为线粒体载体蛋白超家族,保守功能域为线粒体二羧酸载体,含294个氨基酸残基,理论分子量为32132.2Da。与曼氏血吸虫进化地位最接近;有1个信号肽位点和6个潜在的抗原表位。结论曼氏迭宫绦虫线粒体二羧酸载体能够介导苹果酸、琥珀酸等二羧酸的转运,使其跨越线粒体膜参与三羧酸循环,为虫体自身提供能量,可能是潜在的疫苗候选分子及药物作用靶点。
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| 关 键 词： | 曼氏迭宫绦虫 线粒体载体蛋白 二羧酸载体 生物信息学分析 |
Bioinformatics analysis for structure and function of mitochondrial carrier protein superfamily from Spirometra mansoni |
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| LU Ya-jun
,
SHI Da-zhong
,
ZHONG Sai-feng
,
GAN Xiu-feng
,
LU Gang.Bioinformatics analysis for structure and function of mitochondrial carrier protein superfamily from Spirometra mansoni[J].Hainan Medical Journal,2013,24(13):1879-1882. |
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| Authors: | LU Ya-jun SHI Da-zhong ZHONG Sai-feng GAN Xiu-feng LU Gang |
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| Institution: | LU Ya-jun, SHI Da-zhong, ZHONG Sai-feng, GAN Xiu-feng, LU Gang. Department of Pathogen Biology, School of Tropical medicine and laboratory medicine, Hainan Medical University, Haikou 571199, Hainan, CHINA |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Spirometra mansoni Mitochondrial carrier protein Dicarboxylate Carrier (DIC) Bioinformatics analysis |
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