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双向凝胶电泳—飞行时间质谱法分析人肺鳞细胞NCI—H520蛋白质组成分
引用本文:詹显全,陈主初,关勇军,李萃,何春梅,梁宋平,谢锦云,陈平. 双向凝胶电泳—飞行时间质谱法分析人肺鳞细胞NCI—H520蛋白质组成分[J]. 癌症, 2001, 20(6): 575-582
作者姓名:詹显全  陈主初  关勇军  李萃  何春梅  梁宋平  谢锦云  陈平
作者单位:中南大学湘雅医学院肿瘤研究所!湖南长沙410078,中南大学湘雅医学院肿瘤研究所!湖南长沙410078,中南大学湘雅医学院肿瘤研究所!湖南长沙410078,中南大学湘雅医学院肿瘤研究所!湖南长沙410078,中南大学湘雅医学院肿瘤研究所!湖南长沙410078,湖南师范大学生命科学院!湖南长沙4100
基金项目:中国博士后科学研究基金(中博基[2000]23号 );湖南省科委研究基金(2000年 );国家自然科学基金(编号:30000028)
摘    要:
目的:建立和优化肿瘤蛋白质组研究的方法系统,并分析人肺鳞癌细胞蛋白质组。方法:用固相 pH梯度双向凝胶电泳分离人肺鳞癌细胞系NCI-H520总蛋白,银染显色,PDQuest 2DE软件分析,对部分蛋白质 点用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flying mass  spectrometry, MALDI-TOF-MS)测定其胶内酶解后的肽质指纹图谱,用 PeptIdent软件查询 SWISS-PROT数据库。结果:获得了分辨 率和重复性均较好的双向电泳银染图谱,图像分析探测到3块胶的平均蛋白质点数为(1146±116),平均匹配的点 数为(851±95),匹配率达 73. 7%, 3 块胶在蛋白质点位置上具有较好的重复性, IEF方向的平均偏差为(1. 52± 0.22)mm,SDS-PAGE方向的平均偏差为(1.97 ± 0.13)mm。随机取60个蛋白质点进行胶内原位酶解-质谱指纹图 分析得到了54个蛋白质点的肽质指纹图,查询数据库初步鉴定了44个蛋白质,其中部分是与细胞周期有关的蛋 白,部分是与信号传导有关的蛋白,部分

关 键 词:双向电泳 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 肺肿瘤 鳞癌细胞 NCI-G520
文章编号:1000-467X(2001)06-0575-08
修稿时间:2001-02-07

Analysis of Human Lung Squamous Carcinoma Cell Line NCI-H520 Proteome by Two-Dimensional Electrophoresis and MALDI-TOF-Mass Spectrometry
ZHAN Xian-quan,CHEN Zhu-chu,GUAN Yong-jun,LI Cui,HE Chun-mei,LIANG Song-ping,XIE Jin-yun,CHEN Ping. Analysis of Human Lung Squamous Carcinoma Cell Line NCI-H520 Proteome by Two-Dimensional Electrophoresis and MALDI-TOF-Mass Spectrometry[J]. Chinese journal of cancer, 2001, 20(6): 575-582
Authors:ZHAN Xian-quan  CHEN Zhu-chu  GUAN Yong-jun  LI Cui  HE Chun-mei  LIANG Song-ping  XIE Jin-yun  CHEN Ping
Abstract:
Keywords:Immobilized pH gradient-two dimensional gel electrophoresis  MALDI-TOF mass spectrometry  Human lung squamous carcinoma cell  Proteome
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
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