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| ST239-spa t037 MRSA与ST239-spa t030 MRSA的比较基因组分析 | |
| 引用本文： | 李荷楠,赵春江,陈宏斌,张菲菲,刘亚丽,杨瑞馥,周冬生,王辉. ST239-spa t037 MRSA与ST239-spa t030 MRSA的比较基因组分析[J]. 中华微生物学和免疫学杂志, 2012, 32(9) |
| 作者姓名： | 李荷楠 赵春江 陈宏斌 张菲菲 刘亚丽 杨瑞馥 周冬生 王辉 |
| 作者单位： | 1. 100044,北京大学人民医院检验科 2. 北京协和医院 3. 军事医学科学院微生物流行病研究所 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，新世纪优秀人才支持计划，北京市自然科学基金，国家科技支撑计划重点项目 |
| 摘 要： | 目的 寻找金黄色葡萄球菌基因组进化相关的关键基因.方法 利用含有2457个金黄色葡萄球菌基因的比较基因组芯片对23株不同时间、不同地点分离的ST239-spa t037和ST239-spa t030的甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant S.aureus,MRSA)进行比较基因组分析,鉴定差异区段,并利用PCR验证差异基因.结果 通过对北京地区MRSA早期克隆(ST239-spat037,1994-1998年)和晚期克隆(ST239-spa t030,2000-2006年)的比较基因组分析,发现4个基因簇仅存在于晚期克隆,主要定位于3个已知的基因组岛(vSa4,前噬菌体ΦSa1和ΦSa3).不同地区的ST239-spa t030 MRSA的比较基因组分析发现:在不同地区的菌株中有8个基因存在差异.结论 北京地区MRSA从t037进化到t030的过程中获得3个基因组岛(vSa4、前噬菌体ΦSa1和ΦSa3),从而增强了ST239-spa t030 MRSA的毒力和适应性,对其取代ST239-spa t037 MRSA发挥关键作用. |
| 关 键 词： | 甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌 比较基因组杂交 基因组岛 进化 |
Comparative genomic analysis of ST239-spa t037 MRSA and ST239-spa t030 MRSA |
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| LI He-nan , ZHAO Chun-jiang , CHEN Hong-bin , ZHANG Fei-fei , LIU Ya-li , YANG Rui-fu , ZHOU Dong-sheng , WANG Hui. Comparative genomic analysis of ST239-spa t037 MRSA and ST239-spa t030 MRSA[J]. Chinese Journal of Microbiology and Immunology, 2012, 32(9) | |
| Authors: | LI He-nan ZHAO Chun-jiang CHEN Hong-bin ZHANG Fei-fei LIU Ya-li YANG Rui-fu ZHOU Dong-sheng WANG Hui |
| Abstract: | |
| Keywords: | Methicillin-resistant S. aureus Comparative genomic hybridization Genomic island Evolution |
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