润滑障碍中的lncRNA⁃mRNA共表达网络的构建及功能预测 |
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作者姓名: | 刘天娇 张晶晶 马洁桦 潘连军 阮红杰 |
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作者单位: | 南京医科大学附属妇产医院妇女保健科,江苏 南京 210004;南京医科大学附属妇产医院产科,江苏 南京 210004;南京医科大学附属妇产医院医学研究中心,江苏 南京 210004;南京医科大学附属妇产医院泌尿外科,江苏 南京 210004;南京医科大学附属妇产医院急诊医学科,江苏 南京 210004 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81771572) |
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摘 要: | 目的:通过构建阴道润滑障碍(lubrication disorder,LD)女性阴道上皮组织差异表达lncRNA?mRNA共表达网络,探索LD患者的潜在发病机制。方法:利用以|Log2FC|≥2且校正后P值<0.05,鉴别LD和正常对照组之间的长链非编码RNA(long non?coding RNA,LncRNA)以及mRNA的表达谱,利用Cytoscape软件构建差异表达lncRNA及差异表达mRNA网络,采用Gene Ontology(GO)和KEGG Pathway分析共表达网络中mRNA的生物学功能。结果:通过下一代测序技术,根据|Log2FC|≥2且校正后P值<0.05标准筛选出LD组和正常对照组中共计499条上调表达的lncRNA、337条下调表达的lncRNA,以及1 582条上调表达mRNA、633条下调表达的mRNA。随后,通过其中100个lncRNA与311个mRNA构建了基于差异表达的lncRNA和mRNA的共表达网络。最后,共表达网络的功能富集分析表明mRNA主要与心肌相关的疾病和功能有关。结论:LD的发病机制可能与血液循环功能障碍、局部肌肉功能障碍以及cGMP通路等有关,需要相关研究来进一步证实。
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关 键 词: | 阴道润滑障碍;长链非编码RNA;共表达网络 |
收稿时间: | 2021-04-13 |
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