| 创伤性脑损伤大鼠模型中与铁死亡相关的基因探索 |
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| 引用本文： | 杨莉,李坪,吴海鹰,杨方林,杨怡然,揭娟,钱传云. 创伤性脑损伤大鼠模型中与铁死亡相关的基因探索[J]. 中国急救医学, 2022, 0(2) |
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| 作者姓名： | 杨莉 李坪 吴海鹰 杨方林 杨怡然 揭娟 钱传云 |
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| 作者单位： | 昆明医科大学第一附属医院急诊医学科;昆明医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学系;昆明市延安医院重症医学科 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(82060241);云南省科技厅-昆明医科大学应用基础研究联合专项[2018FE001(-004)];云南省创新团队(2019HC014)。 |
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| 摘 要： | ![]()
目的探索创伤性脑损伤(traumatic brain injury,TBI)大鼠模型中铁死亡的发生及与其密切相关的基因。方法将SD大鼠随机分为Sham组和TBI组,采用普鲁士蓝(Perl′s)染色和透射电镜观察TBI大鼠脑组织发生铁沉积和铁死亡的情况;转录组测序初步鉴定TBI大鼠脑组织差异表达基因(differentially express genes,DEGs),将DEGs与数据集GSE111452比较,选择共有的DEGs,再将共有DEGs与铁死亡数据库比对,最终筛选出与铁死亡密切相关的DEGs;最后,通过荧光定量PCR检测大鼠脑组织样本中DEGs的mRNA相对表达量。结果Perl′s染色结果显示,TBI大鼠脑组织损伤周围区域铁离子沉积现象较Sham组明显;电镜结果显示,TBI大鼠脑组织中神经元形态改变,线粒体萎缩变小,基质颜色变深,膜增厚致密度高,部分外膜模糊并破损,伴有内嵴扩张、减少。测序和信息学分析结果显示,与Sham组比较,TBI大鼠脑组织共有2786个DEGs,与GSE111452数据集交集后发现241个共有DEGs,再与铁死亡相关基因库比对,发现4个与铁死亡相关的DEGs(Slc7a5、Rb1、Fancd2和Pebp1);PCR检测结果显示,TBI大鼠脑组织中Slc7a5和Fancd2基因的mRNA表达水平显著升高,Rb1基因的mRNA表达水平也有升高趋势,但与Sham组比较差异无统计学意义(P>0.05),Pebp1基因的mRNA表达水平显著下降(P<0.05)。结论TBI大鼠脑组织发生了铁死亡,可能与Slc7a5、Rb1、Fancd2和Pebp1基因在TBI大鼠脑组织的差异表达有关。
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| 关 键 词： | 创伤性脑损伤(TBI) 铁死亡(Ferroptosis) 转录组测序 生物信息学分析 |
To explore the ferroptosis related genes in traumatic brain injury rats |
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| Yang Li,Li Ping,Wu Hai-ying,Yang Fang-lin,Yang Yi-ran,Jie Juan,Qian Chuan-yun. To explore the ferroptosis related genes in traumatic brain injury rats[J]. Chinese Journal of Critical Care Medicine, 2022, 0(2) |
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| Authors: | Yang Li Li Ping Wu Hai-ying Yang Fang-lin Yang Yi-ran Jie Juan Qian Chuan-yun |
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| Affiliation: | (Emergency Department,the First Affiliated Hospital of Kunming Medical University,Kunming 650500,China) |
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| Abstract: | ![]()
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