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EBV病毒全基因组cDNA探针的设计与制备
引用本文:方唯意 郑文岭 马文丽 刘腾飞 王爽 谢卫兵 李虹 任彩萍 姚开泰. EBV病毒全基因组cDNA探针的设计与制备[J]. 第一军医大学学报, 2005, 25(3): 246-250
作者姓名:方唯意 郑文岭 马文丽 刘腾飞 王爽 谢卫兵 李虹 任彩萍 姚开泰
作者单位:[1]中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,湖南,长沙,410078 [2]广州军区总医院肿瘤研究所,广东广州510010 [3]南方医科大学分子生物研究所,广东,广州,510515 [4]南方医科大学肿瘤研究所,广东,广州,510515 [5]中南大学湘雅医学院肿瘤研究所,湖南,长沙,410078//南方医科大学肿瘤研究所,广东,广州,510515
摘    要:目的设计和克隆所有EB病毒(EBV)已知和预计的编码基因作为cDNA探针用于构建EBV微阵列,以促进研究EBV在其相关疾病中的发病学作用.方法cDNA探针首先由Oligo6.0,Blast和Primer Primier软件设计和筛选全 EBV基因组探针,它们的长度被定在300~600 mer并且具有高度特异性.从B95-8细胞和NPC组织的基因组DNA和 RNA中,通过PCR和RT-PCR方法扩增这些探针,之后克隆入T/A克隆载体.所有的探针被测序鉴定.结果除LF1和LF3基因在B95-8细胞的EBV基因组中不存在外,其余85个基因片段(BWRFl基因有7个重复阅读框架)和两个EBERs基因被成功克隆.结论EBV cDNA探针的设计和克隆为制备EBV微阵列和进一步研究EBV基因组在其相关疾病中的作用奠定了基础.

关 键 词:EBV基因 cDNA探针 EBV基因芯片 基因克隆

Design and preparation of Epstein-Barr virus genome-wide cDNA probes.
Wei-Yi Fang,Wen-Ling Zheng,Wen-Li Ma,Teng-Fei Liu,Shuang Wang,Wei-Bing Xie,Hong Li,Cai-Peng Ren,Kai-Tai Yao. Design and preparation of Epstein-Barr virus genome-wide cDNA probes.[J]. Journal of First Military Medical University, 2005, 25(3): 246-250
Authors:Wei-Yi Fang  Wen-Ling Zheng  Wen-Li Ma  Teng-Fei Liu  Shuang Wang  Wei-Bing Xie  Hong Li  Cai-Peng Ren  Kai-Tai Yao
Affiliation:Institute of Cancer Research, Xiangya Medical School, Central South University, Changsha 410078, China. fangweiyi1975@yahoo.com.cn
Abstract:
Keywords:
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