| 基于生物信息学的食管鳞癌关键基因筛选 |
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| 引用本文： | 苏毅馨,李林潞,毛昀,褚雪镭,陈峥,朱世杰. 基于生物信息学的食管鳞癌关键基因筛选[J]. 重庆医学, 2021, 50(11): 1915-1921. DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2021.11.026 |
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| 作者姓名： | 苏毅馨 李林潞 毛昀 褚雪镭 陈峥 朱世杰 |
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| 作者单位： | 中国中医科学院望京医院肿瘤科,北京 100102 |
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| 摘 要： | 目的 探索食管鳞癌(ESCC)基因调控机制以寻找诊治相关潜在的生物标志物.方法 整合GEO数据库中ESCC基因芯片数据集获得共同差异表达基因(DEGs),进行基因本体(GO)和基因组百科全书数据库(KEGG)分析,构建蛋白互作网络后筛选出核心DEGs.利用GEPIA进行表达差异及生存分析,经UALCAN验证差异分析结果.结果 33例ESCC组织及15例正常组织中筛选出86个DEGs.GO和KEGG富集分析结果显示,差异基因功能主要涉及细胞周期、细胞分化、转化生长因子-β(TGF-β)信号通路等,蛋白互作分析网络筛选出27个核心基因,其中与患者预后相关基因两个:CKDN3、KIF4A.结论 CKDN3、KIF4A在ESCC组织中高表达,与ESCC预后相关,有助于ESCC的诊断及预后.
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| 关 键 词： | 食管鳞肿瘤 差异表达基因 生物标志物 生物信息学 |
Key genes screening in esophageal squamous cell carcinoma based on bioinformatics |
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| SU Yixin,LI Linlu,MAO Yun,CHU Xuelei,CHEN Zheng,ZHU Shijie. Key genes screening in esophageal squamous cell carcinoma based on bioinformatics[J]. Chongqing Medical Journal, 2021, 50(11): 1915-1921. DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2021.11.026 |
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| Authors: | SU Yixin LI Linlu MAO Yun CHU Xuelei CHEN Zheng ZHU Shijie |
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