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microRNAs调控基质金属蛋白酶与乳腺癌发生发展和转移的生物信息学分析
引用本文:刘婧婷,隆建萍,刘倩,王燕侠,金凤玲,林碧玉.microRNAs调控基质金属蛋白酶与乳腺癌发生发展和转移的生物信息学分析[J].重庆医科大学学报,2021,46(10):1228-1233.
作者姓名:刘婧婷  隆建萍  刘倩  王燕侠  金凤玲  林碧玉
作者单位:兰州大学第一临床学院,兰州730000;甘肃省妇幼保健院乳腺一科,兰州730050;甘肃省妇幼保健院妇幼保健科研中心,兰州730050
基金项目:甘肃省科技计划自然科学基金立项资助项目(17JR5RA030)
摘    要:目的:利用生物信息学方法研究microRNAs调控基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)乳腺癌的潜在靶向基因、信号传导通路及分子机制.方法:从GEO和TCGA数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌样本的基因芯片;使用R软件包limma分析正常乳腺组织和乳腺癌样本之间的差异表达基因;对筛选出的差异表达基因进行KEGG信号通路富集分析.结果:通过对差异基因的趋势分析,筛选出544个显著上调的基因及1030个显著下调的基因,其中MMP1/3/9/11/13/28可能为介导乳腺癌浸润性进展的相关基因.生存分析表明,乳腺癌MMP1/3/9/11/13高表达与不良预后相关,且MMP1高表达是影响乳腺癌的独立危险因素(P<0.01).结论:本研究的整合生物信息学分析表明,MMPs在乳腺癌等多种癌组织中表达升高,并且MMPs表达明显影响乳腺癌患者预后,与其他MMPs相比,MMP1可能是乳腺癌患者靶向治疗的合适靶点.

关 键 词:乳腺癌  基质金属蛋白酶  生物信息学
收稿时间:2019/12/20 0:00:00

Bioinformatics analysis of microRNAs regulation of matrix metalloproteinases in the occurrence, progression and metastasis of breast cancer
Liu Jingting,Long Jianping,Liu Qian,Wang Yanxi,Jin Fengling,Lin Biyu.Bioinformatics analysis of microRNAs regulation of matrix metalloproteinases in the occurrence, progression and metastasis of breast cancer[J].Journal of Chongqing Medical University,2021,46(10):1228-1233.
Authors:Liu Jingting  Long Jianping  Liu Qian  Wang Yanxi  Jin Fengling  Lin Biyu
Institution:1. The First Clinical Medical College, Lanzhou University;2. Department of Breast Surgery, Gansu Provincial Maternity and Child-care Hospital;3. Maternal and Child Health Care Research Center, Gansu Provincial Maternity and Child-care Hospital
Abstract:
Keywords:breast cancer  matrix metalloproteinases  bioinformatics
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