| 用gyrB、rpoD基因扩增测序进行气单胞菌分类的探讨 |
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| 引用本文： | 贺桃凤,李医,陈晓,陈瑜.用gyrB、rpoD基因扩增测序进行气单胞菌分类的探讨[J].临床检验杂志,2015(8):569-572. |
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| 作者姓名： | 贺桃凤 李医 陈晓 陈瑜 |
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| 作者单位： | 浙江大学医学院，杭州 310010/宁波市北仑区人民医院梅山分院检验科，浙江宁波 315000;新疆维吾尔自治区职业病医院检验科，新疆维吾尔自治区 830091;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州 310010;浙江大学医学院附属第一医院检验科，杭州 310010 |
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| 基金项目： | “十二五”国家科技重大专项(2012ZX10004-210)。 |
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| 摘 要： | 目的获得气单胞菌更准确的分类结果。方法收集经Vitek全自动细菌分析仪及配套的GN鉴定卡鉴定为气单胞菌的菌株231株,对其gyr B、rpo D两个管家基因进行PCR扩增及测序,并与Gen Bank中标准序列进行基因序列比对和单核苷酸替代率分析,综合分析gyr B、rpo D两基因测序结果并进行基因分类。结果 231株气单胞菌中,69株(29.9%)gyr B和rpo D基因均获得测序结果,86株(37.2%)仅获得gyr B序列,50株(21.6%)仅获得rpo D序列,26株(11.3%)两种基因均未获得序列。生化表型鉴定为嗜水气单胞菌的菌株中62.7%基因分类结果为达卡气单胞菌,仅22.4%为嗜水气单胞菌,其种间生化反应结果相近。结论气单胞菌属的生化分类与基因分类结果存在差异。达卡气单胞菌与嗜水气单胞菌的鉴定依赖于基因序列分析。
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| 关 键 词： | 气单胞菌 基因分类 gyrB rpoD 嗜水气单胞菌 达卡气单胞菌 |
| 收稿时间： | 3/5/2015 12:00:00 AM |
Genetically classification of Aeromonas strains identified by gyrB and rpoD gene |
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