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基于16S rRNA高通量测序分析9种中药饮片污染微生物群落特征
作者姓名:陈柯  陈敏  林黎  邹惠亮
作者单位:湖州市食品药品检验研究院
摘    要:
目的:基于16S核糖体RNA(16S r RNA)高通量测序分析浙江省湖州市南太湖地区9种中药饮片的污染微生物群落特征。方法:根据《中华人民共和国药典》(2020年版)对柴胡、白术、山药、玄参、麦冬、焦栀子、砂仁、铁皮枫斗、金银花共9种中药饮片进行控制菌检查和分类鉴定,同时采用16S rRNA高通量测序法测定基因序列并将优化后的序列与数据库比对,进行多样性分析,分析微生物群落特征。结果:(1)90批中药饮片中有1批山药检测出沙门菌和大肠埃希菌,有41批(45.56%)检出耐胆盐革兰氏阴性菌。经菌落鉴定共获得4个科10个属共15种污染微生物,其中包括阴沟肠杆菌、铜绿假单胞菌、阪崎克罗诺杆菌、沙门氏菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯氏菌、鲍曼不动杆菌、奇异变形杆菌等致病菌或条件致病菌。(2)高通量测序共获得32个属、186种污染微生物,山药、白术、柴胡鉴定出的微生物种类最高,分别为112、95、88,焦栀子、铁皮枫斗和麦冬获得微生物种类最少,分别为20、26、34。经多样性分析,柴胡、白术和山药具有最高的Chaol指数,柴胡、山药和砂仁具有最高的Shannon指数,柴胡、山药和砂仁具有最高的Sim...

关 键 词:高通量测序  中药饮片  微生物污染  群落特征  耐胆盐微生物  16S r RNA
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