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基于生物信息学分析microRNA-495-5p在早产儿支气管肺发育不良中的表达及其临床意义
引用本文:孙祎璠,马俐,龚小慧,洪文超,蔡成.基于生物信息学分析microRNA-495-5p在早产儿支气管肺发育不良中的表达及其临床意义[J].中国当代儿科杂志,2020,22(1):24-30.
作者姓名:孙祎璠  马俐  龚小慧  洪文超  蔡成
作者单位:孙祎璠, 马俐, 龚小慧, 洪文超, 蔡成
基金项目:国家自然科学基金(81571467)。
摘    要:目的 探讨支气管肺发育不良(BPD)早产儿血清中microRNA-495-5p(miRNA-495-5p)的表达变化并对其进行生物信息学分析,为深入研究miRNA-495-5p与BPD的关系提供理论依据。方法 收集2015年1月至2016年12月NICU住院治疗早产儿的一般临床资料,选取具有早期BPD临床表现的20例患儿为BPD组,无早期BPD临床表现的20例患儿为对照组。采集两组患儿末梢外周血,每组各随机选取5例患儿,应用miRNA芯片技术筛选两组患儿血清中差异性表达的miRNAs;每组各随机选取6例患儿,采用RT-PCR技术再次验证其差异性表达。应用TargetScan、miRDB、miRWalk数据库对miRNA-495-5p进行靶基因预测;采用DAVID数据库对靶基因进行基因功能富集分析和信号转导通路富集分析。结果 与对照组患儿相比,BPD组患儿血清miRNA-495-5p表达显著上调(P < 0.05)。通过3种数据库预测miRNA-495-5p的靶基因共有117个,其靶基因功能分别富集于转录调节活性、转录激活活性、转录辅助激活活性等分子功能,代谢过程的调控、依赖DNA的转录调控、血管模式等生物学过程,以及核质、膜组分、不溶性组分等细胞组分上(P < 0.05);信号转导通路则显著富集于mTOR信号通路中(P < 0.05)。结论 miRNA-495-5p可能通过调控新生血管生成、干细胞分化、细胞凋亡及自噬等参与BPD的发生发展,为后续深入研究其在BPD中的作用及功能机制提供了重要线索。

关 键 词:支气管肺发育不良  microRNA-495-5p  生物信息学  早产儿  
收稿时间:2019-08-29
修稿时间:2019/12/23 0:00:00

Expression of microRNA-495-5p in preterm infants with bronchopulmonary dysplasia: a bioinformatics analysis
SUN Yi-Fan,MA Li,GONG Xiao-Hui,HONG Wen-Chao,CAI Cheng.Expression of microRNA-495-5p in preterm infants with bronchopulmonary dysplasia: a bioinformatics analysis[J].Chinese Journal of Contemporary Pediatrics,2020,22(1):24-30.
Authors:SUN Yi-Fan  MA Li  GONG Xiao-Hui  HONG Wen-Chao  CAI Cheng
Institution:SUN Yi-Fan, MA Li, GONG Xiao-Hui, HONG Wen-Chao, CAI Cheng
Abstract:
Keywords:

Bronchopulmonary dysplasia|microRNA-495-5p|Bioinformatics|Preterm infant

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