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| 人干扰素-λ的二级结构及其B细胞抗原表位的预测 | |
| 引用本文： | 李明才,黄东阳. 人干扰素-λ的二级结构及其B细胞抗原表位的预测[J]. 汕头大学医学院学报, 2006, 19(4): 201-203 |
| 作者姓名： | 李明才 黄东阳 |
| 作者单位： | 1. 汕头大学医学院变态反应学与炎症学研究所 2. 汕头大学医学院变态反应学与炎症学研究所;汕头大学医学院分子生物学中心,广东,汕头,515041 |
| 摘 要： | 目的：预测人干扰索（IFN）-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的二级结构特征及其B细胞抗原表位。方法：用Ceour-Deleage法预测人IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的二级结构；分别用Hopp-Woods法、Janin法、Zimmerman．Simha法和Bhaskaran-Ponnuswamy法分析各蛋白的亲水性、可及性、极性和柔韧性参数；用Kolaskar-Tongaonkar法预测各蛋白的抗原指数。结合人IFN-λ1、IFN-λ2．和IFN-λ3的二级结构特征。综合评价其B细胞抗原表位。结果：人IFN-λ1、IFN-λ2和WN．IFN-λ2的B细胞识别表位可能分别位于其第47～73和154-166、53～75和159-171、53～77和159～171位氨基酸等区域内或附近，被预测的表位均含有β-转角和无规卷曲结构。人IFN-λ1与IFN-λ2，IFN-λ3的二级结构和含有的B细胞优势抗原表位很相似，而人IFN-λ2和IFN-λ3之间的差别非常小。结论：该预测结果将有助于确定人IFN-λ1、IFN-λ2和IFN-λ3的B细胞表位及其生物学活性部位。 |
| 关 键 词： | 人干扰素-λ 二级结构 B细胞表位 预测 |
| 文章编号： | 1007-4716（2006）04-0201-03 |
| 收稿时间： | 2006-11-02 |
| 修稿时间： | 2006-11-02 |
Prediction of the Secondary Structures and B Cell Epitopes of Human Interferon-λ |
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| LI Ming-cai,HUANG Dong-yang. Prediction of the Secondary Structures and B Cell Epitopes of Human Interferon-λ[J]. Journal of Shantou University Medical College, 2006, 19(4): 201-203 | |
| Authors: | LI Ming-cai HUANG Dong-yang |
| Affiliation: | 1 Allergy and Inflammation-Research. Institute, Shantou University Medical College, Shantou 515041, China; 2 Center for Molecular Biology, Shantou University Medical College, Shantou 515041, China |
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