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苦水玫瑰ITS及ITS2序列分析与鉴别
引用本文:张平,黄聪琳,王晓琳,马潇,杨平荣,郑健. 苦水玫瑰ITS及ITS2序列分析与鉴别[J]. 中国现代中药, 2021, 23(7): 1190-1194
作者姓名:张平  黄聪琳  王晓琳  马潇  杨平荣  郑健
作者单位:1.甘肃省药品检验研究院,甘肃 兰州 730070;2.甘肃省中藏药检验检测技术工程实验室,甘肃 兰州 730070;3.甘肃省中医院,甘肃 兰州 730050;4.中国食品药品检定研究院,北京 100050
基金项目:甘肃省药品科研项目(2019GSMPA023);甘肃省药品监督管理局中药材及饮片质量控制重点实验室项目(2020GSMPA-KL06-2);甘肃省科技重大专项(17ZD2FA009)
摘    要:目的:对苦水玫瑰、平阴玫瑰、月季、金边玫瑰、法兰西玫瑰进行DNA条形码序列比对,对苦水玫瑰予以鉴别。方法:对样本的细胞核基因内转录间隔区(ITS)和ITS2片段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序,所得序列经Codon Code Aligner 3.7.1软件拼接后,用MEGA 5.0软件进行序列的分析比对,采用邻接法(NJ)构建系统聚类树。结果:ITS引物扩增产物中大部分样品的测序结果双峰严重,无法有效拼接,可用数据量低,含不确定性碱基比例高,因此未对该部分数据进行分析;平阴玫瑰与对照药材均可获得高质量的ITS2序列,且序列完全一致,苦水玫瑰的ITS2序列(序列6和8)与平阴玫瑰及玫瑰对照药材相比存在1~2个变异位点,月季、法兰西玫瑰与平阴玫瑰及玫瑰对照药材相比存在≥2个变异位点。结论:利用ITS2序列能够有效区分苦水玫瑰及其他同属物种样品。

关 键 词:苦水玫瑰  内转录间隔区(ITS)序列  ITS2序列  分子鉴定
收稿时间:2020-04-23

Analysis and Identification of ITS and ITS2 Sequences in Rosa rugose 'Kushui'
ZHANG Ping,HUANG Cong-lin,WANG Xiao-lin,MA Xiao,YANG Ping-rong,ZHENG Jian. Analysis and Identification of ITS and ITS2 Sequences in Rosa rugose 'Kushui'[J]. Modern Chinese Medicine, 2021, 23(7): 1190-1194
Authors:ZHANG Ping  HUANG Cong-lin  WANG Xiao-lin  MA Xiao  YANG Ping-rong  ZHENG Jian
Affiliation:1.Gansu Institute for Drug Control, Lanzhou 730070, China;2.Gansu Engineering Laboratory for Inspection and Testing Technology of Chinese and Tibetan Medicine, Lanzhou 730070, China;3.Gansu Provincial Hospital of Traditional Chinese Medicine, Lanzhou 730050, China;4.National Institutes for Food and Drug Control, Beijing 100050, China
Abstract:
Keywords:Rosa rugosa ''Kushui''  ITS sequence  ITS2 sequence  molecular identification
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