| 基于RNA-seq的脓毒症相关性脑病小鼠海马转录组分析及竞争性内源性RNA调控网络的构建题录 |
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| 引用本文： | 张英立,于明懂,刘乘麟,李佩,王慧星,张婧,魏立国,于泳浩,谢克亮,卢悦淳.基于RNA-seq的脓毒症相关性脑病小鼠海马转录组分析及竞争性内源性RNA调控网络的构建题录[J].中华麻醉学杂志,2023(9). |
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| 作者姓名： | 张英立 于明懂 刘乘麟 李佩 王慧星 张婧 魏立国 于泳浩 谢克亮 卢悦淳 |
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| 作者单位： | 1. 天津医科大学第二医院麻醉科;2. 天津市天津医院麻醉科;3. 天津医科大学第二医院疼痛治疗中心;4. 天津医科大学总医院麻醉科 天津市麻醉学研究所 |
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| 摘 要： | 目的采用转录组测序技术(RNA-seq)筛选脓毒症相关性脑病(SAE)小鼠海马差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)及mRNA, 构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络。方法清洁级健康雄性C57BL/6小鼠10只, 6～8周龄, 体质量20～25 g, 采用随机数字表法分为2组(n=5):假手术组(Sham组)和脓毒症组(Sepsis组)。Sepsis组采用盲肠结扎穿孔(CLP)法制备小鼠脓毒症模型, Sham组只开腹不进行盲肠结扎和穿孔。分别于术前1 d及术后3 d时行Morris水迷宫实验和条件恐惧实验检测小鼠认知功能。随后Sham组随机处死3只小鼠, Sepsis组处死认知功能测试最差的3只小鼠, 取海马组织, 通过BGISEQ-500平台行转录组测序, 得到差异表达的mRNA和lncRNA, 测序结果通过深圳华大基因科技服务有限公司提供的Dr.Tom平台行可视化分析, 利用Cytoscape软件构建ceRNA调控网络。结果与Sham组比较, Sepsis组逃避潜伏期延长, 靶向限停留时间百分比和僵直时间百分比降低(P<0.05)。转录组数据分析共获得差异表达的l...
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| 关 键 词： | 脓毒症相关性脑病 基因表达谱 高通量核苷酸序列分析 RNA |
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