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汉坦病毒M基因区核苷酸序列及G1膜蛋白部分氨基酸共享序列分析
引用本文:乔刚,杨兆红,龚艳,程茂玲,李艳,于萍,肖辉钊,王学. 汉坦病毒M基因区核苷酸序列及G1膜蛋白部分氨基酸共享序列分析[J]. 中华检验医学杂志, 2004, 27(11): 792-795
作者姓名:乔刚  杨兆红  龚艳  程茂玲  李艳  于萍  肖辉钊  王学
作者单位:1. 266400,山东省胶南市人民医院检验科
2. 266400,山东省胶南市人民医院内科
基金项目:青岛科学技术基金(2000178号)
摘    要:目的对青岛地区31株汉坦病毒分离株M区基因序列测定及基因分型研究,为疫苗接种提供依据。方法从64例肾综合征出血热(HFRS)患者发热期血清标本中提取RNA,应用套式逆转录聚合酶链反应扩增汉坦病毒基因组M片段,G1基因区克隆并测定核苷酸序列和部分共享氨基酸序列,且对测定结果应用DNA Star和Prosis软件进行分析。结果64份标本中测出汉滩型(HTN)6份,占9%;汉城型(SEO)25份,占39%;总阳性率48%。SEO型汉坦病毒间核苷酸序列的差异相对较小,其基因的离散度为0.3%~8.9%。HTN型汉坦病毒变异率较高,基因的离散度为2.6%~11.2%。结论SEO型汉坦病毒基因型相对保守,而HTN型变异率较高;M区段可编码一个具有稳定的保守抗原表位。

关 键 词:汉坦病毒 M基因区 核苷酸序列 G1膜蛋白 氨基酸 共享序列
修稿时间:2004-02-11

M genome nucleotide and G1 membrane protein part amino acid consensus sequence analysis of thirty-one Hantavirus isotates
Abstract:
Keywords:Hantavirus  Genes  Sequence analysis  Amino acids
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