利用蛋白互作网络分析挖掘肝癌分子机制 |
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引用本文: | 孙孝国,李 力,王金华. 利用蛋白互作网络分析挖掘肝癌分子机制[J]. 中国肿瘤, 2015, 24(10): 871-874 |
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作者姓名: | 孙孝国 李 力 王金华 |
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作者单位: | 泰安市第一人民医院,泰安市第一人民医院,泰安市第一人民医院 |
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摘 要: | 摘 要:[目的] 从公共数据库收集大量肝癌候选癌基因,利用蛋白互作网络分析,挖掘肝癌分子机制。[方法] 收集Liverome数据库内肝癌候选癌基因,使用String数据构建肝癌候选癌基因的蛋白互作网络,进一步利用MCODE算法寻找定义网络中核心基因模块,然后通过功能富集分析探究模块相关的生物学功能与通路。[结果] 共收集615个肝癌候选癌基因,蛋白互作网络分析得到一个包含486个基因以及2076个互作关系的蛋白互作网络。同时,通过MCODE算法得到6个核心基因模块,这些模块分别富集到“细胞周期”、“药物代谢”、“DNA复制与修复”等特定的生物学功能。[结论] 这些核心基因模块以及相关功能与肝癌发生发展显著相关。
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关 键 词: | 肝癌;基因互作网络;网络模块;分子机制 |
收稿时间: | 2015-04-27 |
Explore the Molecular Mechanism of Liver Cancer by Protein- protein Interaction Network Analysis |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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