| 人牙髓细胞DPDP-2基因的克隆、测序及序列分析 |
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| 引用本文： | 王忠东,郭红延,吴纪楠,凌均棨,肖明振,郭希民,柴玉波. 人牙髓细胞DPDP-2基因的克隆、测序及序列分析[J]. 医学争鸣, 2007, 28(4): 313-316 |
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| 作者姓名： | 王忠东 郭红延 吴纪楠 凌均棨 肖明振 郭希民 柴玉波 |
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| 作者单位： | 中山大学光华口腔医院,广东,广洲,510055;广东省中山市人民医院口腔医疗中心,广东,中山,528400;武警部队总医院口腔科,北京,100039;广东省中山市人民医院口腔医疗中心,广东,中山,528400;中山大学光华口腔医院,广东,广洲,510055;第四军医大学口腔医学院,陕西,西安,710033;军事医学科学院基础医学研究所,北京,100850;第四军医大学基础部,陕西,西安,710033 |
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| 摘 要： | ![]()
目的:在人牙髓细胞中克隆DPDP-2基因,研究其可能的功能.方法:体外培养HDPC和人牙龈成纤维细胞(HGF),应用基于PCR的改良消减杂交技术构建HDPC和HGF cDNA消减文库,批量克隆HDPC和HGF的差异表达基因并测序,使用GenBank的BLAST对测序结果进行同源序列比较,并运用计算机软件PC/GENE 6.60版对筛选到的DPDP-2基因进行结构和功能分析.结果:DPDP-2基因序列全长810 bp,没有一个完整的编码区. 可与KIAA0265 gene拼接成一个长6172 bp的完整序列,编码一个含有83个氨基酸的疏水性蛋白,其二级结构由螺旋结构、卷曲结构和伸展部分所组成. 它们可以通过α,β或α/β折叠而形成三级结构. 抗原表位分析发现它可能有3种抗原决定簇结构,即Glu-Asn-Lys-Arg-Thr-Gly,Leu-Ile-Glu-Arg-Leu-Lys和Glu-Leu-Ala-Trp-Glu-Lys. 该蛋白存在一种跨膜螺旋结构和线粒体运输肽结构. 进一步的分泌信号分析结果也证实它是一种非分泌蛋白. 经BLAST同源蛋白质搜索,在Non-redundant SwissProt sequences和PDB protein database中均未查询到同源蛋白质.结论:DPDP-2所编码的蛋白是一种跨膜蛋白,具有信号转导分子的结构特征,又具有CKⅡ的磷酸化位点,可能与细胞分裂、转录调节过程有关.
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| 关 键 词： | 牙髓/细胞学 牙龈 成纤维细胞 基因文库 序列分析 BLAST分析 |
| 文章编号： | 1000-2790（2007）04-0313-04 |
| 修稿时间： | 2006-10-25 |
Sequence analysis of DPDP-2 gene cloned from human dental pulp cells |
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| WANG Zhong-Dong,GUO Hong-Yan,WU Ji-Nan,LING Jun-Qi,XIAO Ming-Zhen,GUO Xi-Min,CHAI Yu-Bo. Sequence analysis of DPDP-2 gene cloned from human dental pulp cells[J]. Negative, 2007, 28(4): 313-316 |
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| Authors: | WANG Zhong-Dong GUO Hong-Yan WU Ji-Nan LING Jun-Qi XIAO Ming-Zhen GUO Xi-Min CHAI Yu-Bo |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | dental pulp/cytology gingiva fibroblasts gene library sequence analysis BLAST analysis |
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