人胃肠道和胃肠外间质瘤microRNA表达谱的比较 |
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作者姓名: | 林慧 张秀敏 李增山 |
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作者单位: | 第四军医大学基础部病理与病理生理学教研室,陕西,西安,710032 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(No.30901735);西安市科技计划项目\[No. SF1028(4)\] |
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摘 要: | 目的:比较消化道原发胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumors,GISTs)与胃肠外间质瘤(extra-gastrointestinal stromaltumors,EGISTs)microRNA(miRNA)表达谱的差异,分析其与肿瘤原发部位、突变类型等因素间的关系。方法:收集西京医院病理科的8例石蜡样本(5例GISTs、3例EGISTs),利用安捷伦人miRNA表达谱芯片(芯片覆盖866个人miRNA)进行分析。同时通过PCR扩增后直接测序,明确8例样本的基因突变类型。结果:芯片数据经非监督层次聚类分析,显示8例样本分为3簇,具有相同突变类型的1例胃部GIST和1例EGIST构成第1簇,2例胃部GISTs构成第2簇,其余4例(2例小肠GISTs和2例EGISTs)构成第3簇。将5例GISTs按部位分成2组(胃部和肠道),3例EGISTs分别加入miRNA表型相似的组,2组比较后发现12个miRNA表达有显著差异;预测的靶基因多数参与KIT/PDGFRA的信号转导,其中有5个在肠道组显著下调,部分已有报道与肿瘤的演进相关。比较GISTs和EGISTs的表达谱,发现仅有3个miRNA的表达差异具有统计学意义。结论:GISTs和EGISTs的miRNA表型相似,均与肿瘤部位及突变类型关系密切,因此miRNA表型的分析可能有助于GISTs在分子水平上的分类。
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关 键 词: | 胃肠道间质瘤 胃肠外间质瘤 微小RNA 基因突变 石蜡组织 |
收稿时间: | 2010-12-25 |
修稿时间: | 2011-03-21 |
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