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丙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型方法的建立及初步应用
引用本文:杨光,陈姝,崔金环,司建华,谭家驹. 丙型肝炎病毒逆向点杂交基因分型方法的建立及初步应用[J]. 中华流行病学杂志, 2005, 26(6): 440-443
作者姓名:杨光  陈姝  崔金环  司建华  谭家驹
作者单位:528000,广东省佛山市第一人民医院临床医学研究所
摘    要:
目的 利用逆向点杂交技术建立丙型肝炎病毒(HCV)基因分型新方法。方法在HCV5’端非编码区(5’UTR)设计引物与分型探针,将活性氨基标记的分型探针依次固定在尼龙膜上,制成HCV基因分型逆向点杂交检测膜条。分离纯化血清中的HCV RNA,经逆转录反应和生物素标记引物聚合酶链反应(PCR)巢式扩增后,将扩增产物与检测膜条杂交,过氧化物酶和四甲基联苯胺显色,判断基因分型结果。最后,通过与基因测序结果比较确定新方法的有效性。从佛山地区丙型肝炎患者中随机抽取60份经荧光定量PCR方法对HCV RNA进行过定量分析的血清,用新建方法进行HCV基因分型检测。结果新建HCV逆向点杂交基因分型方法可对所有60份HCV RNA拷贝数在10。~10。/ml之间的抽检血清进行基因分型,发现1b型50例,占83.3%;1a型2例,占3.3%;2a型2例,占3.3%;1a、1b混合型5例,占8.0%;1b、2a混合型1例,占1.7%;未发现2b、3a和3b型。新方法基因分型结果与测序分型结果一致。结论PCR一逆向点杂交技术可以准确有效和简便经济地进行HCV基因分型.适用于临床检测与流行病学研究。在佛山地区人群中感染的HCV以1b型为主。

关 键 词:基因分型方法 逆向点杂交 初步应用 丙型肝炎病毒(HCV) 聚合酶链反应(PCR) HCV基因分型 荧光定量PCR方法 四甲基联苯胺 分型结果 丙型肝炎患者 基因分型检测 RNA拷贝数 流行病学研究 杂交技术 分型探针 佛山地区 点杂交检测
收稿时间:2004-09-16
修稿时间:2004-09-16

Development and application of a new hepatitis C virus genotyping method with polymerase chain reaction reverse blot dot technique
YANG Guang,CHEN Shu,CUI Jin-huan,SI Jian-hua and TAN Jia-ju. Development and application of a new hepatitis C virus genotyping method with polymerase chain reaction reverse blot dot technique[J]. Chinese Journal of Epidemiology, 2005, 26(6): 440-443
Authors:YANG Guang  CHEN Shu  CUI Jin-huan  SI Jian-hua  TAN Jia-ju
Affiliation:Institute of Medical Researches, the First People's Hospital of Foshan, Foshan 528000, China.
Abstract:
Keywords:Hepatitis C virus  Genotyping
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