基于微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络的骨关节炎病变的相关分子机制研究 |
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引用本文: | 程晓平,郑文伟,倪国新.基于微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络的骨关节炎病变的相关分子机制研究[J].中华物理医学杂志,2022,44(4):306-311. |
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作者姓名: | 程晓平 郑文伟 倪国新 |
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作者单位: | 福建医科大学附属第一医院康复医学科,福州 350000;福建省微生物研究所,福州 350000;福建医科大学附属第一医院康复医学科,福州 350000;北京体育大学, 北京 100084 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81572219)、福建省卫生健康青年科研课题(2021QNA024)、福建医科大学启航基金项目(2020QH1017) |
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摘 要: | 目的基于miRNA-mRNA调控网络进行生物信息学分析, 探讨骨关节炎病变的相关分子机制。方法从GEO数据库下载人血清样本miRNA表达数据集, 通过R语言limma包获取差异表达miRNA,采用miRwalk 2.0版数据库预测其对应靶基因(mRNA), 并构建miRNA-mRNA调控网络。对靶基因进行功能GO分析和KEGG信号通路分析, 构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络(PPI), 从中筛选出骨关节炎病变的核心基因。结果共筛选出7个差异表达的miRNA(表达均为下调)和900个mRNA, 这些基因主要涉及蛋白结合、DNA结合、转录等生理过程, 参与Cell cycle、p53、Neurotrophin、PI3K-Akt等信号通路。蛋白相互作用分析表明MAPK1、TP53、MAPK14、CCND1、EP300、POLR2E、POLR2F、ABL1、RAC1、SKIV2L2为该调控网络的核心靶基因。结论 OA的发生和发展涉及多个的miRNA、靶基因和作用途径, 而通过构建骨关节炎相关miRNA-mRNA调控网络, 可为找出骨关节炎病的分子机制和今后临床上诊疗提供新的思路。
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关 键 词: | 骨关节炎 微小核糖核酸 信使核糖核酸 调控网络 |
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