| 河南省HIV-1流行毒株pol基因的分型与系统发生分析 |
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| 引用本文： | 杨坤,鲍作义,李韩平,李林,庄道民,李敬云.河南省HIV-1流行毒株pol基因的分型与系统发生分析[J].中国艾滋病性病,2005,11(3):165-167. |
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| 作者姓名： | 杨坤 鲍作义 李韩平 李林 庄道民 李敬云 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心,北京,100071 |
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| 基金项目： | 卫生部艾滋病防治应用性研究项目资助(编号:WA2003-02) |
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| 摘 要： | 目的了解河南省艾滋病病毒1型(HIV1)流行毒株pol基因的亚型及其系统发生情况。方法采集河南省20名艾滋病病人的抗凝全血,分离血浆,用逆转录聚合酶链反应(RTPCR)扩增pol基因部分序列(PR与RT的p55区)并直接进行序列测定,登陆Web站点http://hivweb.lanl.gov确定毒株亚型。用BioEdit和DNASTAR软件的MegAlign模块进行系统发生分析,SPSS软件包对数据进行统计学分析。结果20份标本的pol基因序列系统发生分析显示均为B亚型,且具有较高的系统发生同源性,与东北地区流行毒株的相似度≥97%,PR基因离散率<0.2%,RT基因平均离散率为3.15%(0.7%～5.1%)。PR和RT基因遗传变异的差异具有显著的统计学意义(P<0.001)。结论pol基因的系统发生分析可以作为河南省HIV1毒株亚型确定的方法。河南与东北两地pol基因相似性以及PR与RT基因进化差异的意义,有待进一步研究。
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| 关 键 词： | 艾滋病毒1型（HIV-1） 基因亚型 系统发生分析 |
| 文章编号： | 1672-5662(2005)03-0165-03 |
| 修稿时间： | 2004年9月16日 |
Subtyping and phylogenetic analysis of poi gene sequences for HIV-1 strains isolated in Henan province |
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| YANG Kun,BAO Zuo-yi,LI Han-ping,et al..Subtyping and phylogenetic analysis of poi gene sequences for HIV-1 strains isolated in Henan province[J].Chinese JOurnal of Aids & STD,2005,11(3):165-167. |
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| Authors: | YANG Kun BAO Zuo-yi LI Han-ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | HIV-1 Gene subtype Phylogenetic analysis |
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