亚洲带绦虫烯醇酶基因及其蛋白质的结构与功能 |
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引用本文: | 黄艳,黄江,胡旭初,徐劲,曹开源,余新炳,包怀恩,郎书源.亚洲带绦虫烯醇酶基因及其蛋白质的结构与功能[J].中山医科大学学报,2008,29(5). |
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作者姓名: | 黄艳 黄江 胡旭初 徐劲 曹开源 余新炳 包怀恩 郎书源 |
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作者单位: | [1]中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广东广州510089 [2]中山大学中山医学院免疫学教研室,广东广州510089 [3]贵阳医学院寄生虫学教研室。贵州贵阳550004,广东广州510089 |
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摘 要: | 【目的】分析和预测亚洲带绦虫烯醇酶基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究。【方法】利用美国国家生物技术信息中心和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具,结合其他生物信息学分析软件包,如Pcgene和Vector NTIsuite,从亚洲带绦虫全长cDNA质粒文库中识别烯醇酶基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等。【结果】该基因全长1737bp,编码区为第205~1503bp,编码433个氨基酸,为全长基因。GenBank中与棘口吸虫烯醇酶氨基酸序列同源性最高,达78%。相对分子量理论预测值为46653.5 Ku。没有质体、线粒体定位序列。预测编码蛋白有1个跨膜区,3个亲水性部位。与吸虫属的烯醇酶进化关系最近。【结论】应用生物信息方法从亚洲带绦虫成虫cDNA文库中筛选出了亚洲带绦虫烯醇酶cDNA全长序列并预测得到其结构与功能方面信息。
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关 键 词: | 亚洲带绦虫 烯醇酶 结构 功能 生物信息学 |
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