| 细粒棘球蚴中国大陆株谷胱甘肽s-转移酶结构与功能的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 棘怀庆,孙俊锋,雄英,李宗吉,王娅娜,赵巍. 细粒棘球蚴中国大陆株谷胱甘肽s-转移酶结构与功能的生物信息学分析[J]. 宁夏医科大学学报, 2009, 31(2): 150-153,157 |
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| 作者姓名： | 棘怀庆 孙俊锋 雄英 李宗吉 王娅娜 赵巍 |
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| 作者单位： | 宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004;宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004;宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004;宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004;宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004;宁夏医科大学医学科学技术研究中心,银川,750004 |
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| 摘 要： | 目的 应用生物信息学分析软件预测细粒棘球蚴中国大陆株谷胱甘肽s-转移酶(EgGST)氨基酸序列的结构与功能.方法 应用DNAStar、NCBI/BLAST、Bioetm、SWISS-MODEL等生物信息学软件分析EgGsr的基因序列,推算出其编码的氨基酸序列与其他物种的同源序列,进行多序列同源比对,构建分子进化树;预测二级结构、拓扑结构;同源模建预测三级结构;预测主要抗原表位等.结果 经RT-PCR扩增得到的660bpEgGSIDNA片段,经DNAman分析软件同源性比较发现,与GenBank中检索的EgGST基因序列同源性为99%;EgGST与不同生物间的同源性平均达45%;该基因编码的蛋白分子量为25492.53Da,有219个氨基酸,等电点为7.532,有31个酸性氨基酸,32个碱性氨基酸,52个极性氨基酸和7个非极性氨基酸;有8个抗原表位肽段15G-29R,30E-39C,40S-68R,69G-82Q,83I-90M,91D-120A,121P-133Q,134L-144N.结论 EgGST可能是免疫诊断、药物作用及疫苗潜在的靶分子.
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| 关 键 词： | 细粒棘球蚴中国大陆株 谷胱甘肽s-转移酶 生物信息学 |
Bioinformatics Analysis for the Structure and Function of Glutathione S-tramferase Gene from Echinococcus Granulosus (Chinese Mainland Strain) |
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| JI Huai-qing,SUN Jun-feng,XIONG Ying,LI Zong-ji,WANG Ya-na,ZHAO Wei. Bioinformatics Analysis for the Structure and Function of Glutathione S-tramferase Gene from Echinococcus Granulosus (Chinese Mainland Strain)[J]. Journal of Ningxia Medical College, 2009, 31(2): 150-153,157 |
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| Authors: | JI Huai-qing SUN Jun-feng XIONG Ying LI Zong-ji WANG Ya-na ZHAO Wei |
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