| 工业大麻TCP基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 秦振芬,孟祥霄,陈伟强,万会花,王思凡,杨维,曹雪,孙伟. 工业大麻TCP基因家族的鉴定及表达分析[J]. 中草药, 2023, 54(23): 7806-7814 |
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| 作者姓名： | 秦振芬 孟祥霄 陈伟强 万会花 王思凡 杨维 曹雪 孙伟 |
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| 作者单位： | 中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性评估北京市重点实验室 |
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| 基金项目： | 中国中医科学院中药研究所国家自然科学基金培育专项（ZXKT22010）; |
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| 摘 要： | 目的 TCP基因家族在植物叶片发育、侧枝形成、花器官形成、植物激素合成与信号转导等生理过程中发挥着关键的作用。对工业大麻Cannabis sativa TCP基因进行全基因组鉴定及表达分析为工业大麻TCP基因家族的功能分析提供科学参考。方法 基于已发布的工业大麻基因组,利用生物信息学方法对工业大麻TCP基因家族成员进行鉴定并对其理化性质、基因结构、以及表达模式进行分析。结果 共鉴定出17个工业大麻TCP基因（Cs TCP1～Cs TCP17）分为2类3个亚科（PCF、CIN和CYC/TB1）,编码的氨基酸长度在163～585 aa,蛋白质相对分子质量为18 310～64 070,蛋白等电点介于4.99～9.36,亚细胞定位大部分为细胞核。共线性进化分析发现,工业大麻与拟南芥、番茄、水稻分别存在9、20和6对同源基因。顺式元件预测结果表示光响应元件和脱落酸元件在TCP基因启动子区域分布广泛。基因表达分析结果表明,工业大麻TCP基因的表达存在组织特异性,大部分在叶和花中高表达。结论 为深入研究工业大麻TCP基因家族的功能奠定了基础,进一步阐明了TCP基因可能参与工业大麻生长发育的各个阶段,...
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| 关 键 词： | 生物信息学 工业大麻 TCP基因家族 鉴定 功能分析 |
| 收稿时间： | 2023-04-09 |
Genome-wide identification and expression analysis of TCP gene family in Cannabis sativa |
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| QIN Zhen-fen,MENG Xiang-xiao,CHEN Wei-qiang,WAN Hui-hu,WANG Si-fan,YMNG Wei,CAO Xue,SUN Wei. Genome-wide identification and expression analysis of TCP gene family in Cannabis sativa[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2023, 54(23): 7806-7814 |
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| Authors: | QIN Zhen-fen MENG Xiang-xiao CHEN Wei-qiang WAN Hui-hu WANG Si-fan YMNG Wei CAO Xue SUN Wei |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Beijing for Identification and Safety Evaluation of Chinese Medicine, Institute of Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing 100070, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bioinformatics Cannabis sativa L. TCP gene family identify functional analysis |
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