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缺氧微环境对多发性骨髓瘤转录组和预后的影响及其治疗策略研究
引用本文:李颖, 郑蓓, 蒋慧芳, 应茵, 韩冰, 张美玲, 汪一帆, 王强凤, 李功华. 缺氧微环境对多发性骨髓瘤转录组和预后的影响及其治疗策略研究[J]. 中国现代应用药学, 2021, 38(2): 148-155. DOI: 10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2021.02.004
作者姓名:李颖  郑蓓  蒋慧芳  应茵  韩冰  张美玲  汪一帆  王强凤  李功华
基金项目:浙江省科技计划项目(2016F10026);浙江省自然基金项目(LQY20H300001);浙江省中医药科技计划项目(2019ZB028);浙江省医药卫生科技计划面上项目(2018KY396);浙江省药学会医院药学专项科研资助项目(2020ZYY25)
摘    要:
目的 利用生物信息学的方法分析肿瘤缺氧微环境对多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)转录组的影响,筛选差异基因,为探索细胞耐受缺氧环境的分子机制提供信息。方法 从GEO数据库获得缺氧培养下的MM细胞株以及患者骨髓来源CD38阳性细胞的表达谱芯片,利用Limma包分析缺氧环境下一致性较好的差异基因,对这些差异基因进行GO和KEGG分析,并用TCGA数据库研究其表达水平与MM患者生存的关系。最后利用差异基因预测抑制缺氧微环境的潜在药物。结果 针对2种数据集共筛选得到28个一致性较好的差异基因,这些基因主要参与细胞代谢途径、线粒体结构、自噬等,这可能与MM的缺氧耐受有关。生存分析显示: ANXA1CLUDPYSL3CEP128DDIT4HMGCS1基因的高表达导致MM患者预后变差。CMAP分析提示PARP抑制剂可抑制缺氧相关信号通路。结论 本研究利用生物信息学手段筛选得到了缺氧影响MM的差异基因,发现其中部分基因的高表达可导致MM患者预后变差,这可能与缺氧环境导致肿瘤细胞生存增强有关。PARP抑制剂可能成为缺氧抑制剂,与其他化疗药物联合使用实现更好的治疗效果。

关 键 词:多发性骨髓瘤  缺氧  肿瘤微环境  转录组  生物信息学
收稿时间:2020-02-25

Study on Effect of Hypoxic Microenvironment on the Transcriptome and Survival of Multiple Myeloma and Its Potential Therapeutic Strategy
LI Ying,ZHENG Bei,JIANG Huifang,YING Yin,HAN Bing,ZHANG Meiling,WANG Yifan,WANG Qiangfeng,LI Gonghua. Study on Effect of Hypoxic Microenvironment on the Transcriptome and Survival of Multiple Myeloma and Its Potential Therapeutic Strategy[J]. The Chinese Journal of Modern Applied Pharmacy, 2021, 38(2): 148-155. DOI: 10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2021.02.004
Authors:LI Ying  ZHENG Bei  JIANG Huifang  YING Yin  HAN Bing  ZHANG Meiling  WANG Yifan  WANG Qiangfeng  LI Gonghua
Abstract:
Keywords:
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