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基于DNA条形码分析的霍山石斛及其常见混伪品的初步研究
引用本文:王晖,时玲玲,周珏,朱国萍.基于DNA条形码分析的霍山石斛及其常见混伪品的初步研究[J].中国中药杂志,2018(20):4055-4061.
作者姓名:王晖  时玲玲  周珏  朱国萍
作者单位:安徽师范大学分子生物学与生物技术研究所安徽省重要生物资源保护与利用重点实验室;皖南医学院
基金项目:安徽省自然科学基金项目(1408085MC59)
摘    要:该研究选择叶绿体基因rbcL,matK及核基因组ITS2序列初步探讨石斛属植物的系统发育关系,筛选可用于石斛属药用植物鉴定的DNA条形码通用序列,分析应用DNA条形码对霍山石斛及伪品进行品种鉴定的可能性。使用ITS2,rbcL,matK序列的通用引物对石斛属植物进行扩增测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率,种内和种间的变异等指标,运用Bio Edit,MEGA 5. 0等软件分析序列,构建NJ分子系统树,进而评价不同序列的鉴定能力。结果表明ITS2序列不仅在石斛属种内变异和种间变异最大,而且有明显的条形码间隙,种内变异和种间变异重合较少,ITS2序列不同石斛种形成单系分支的百分比也最高,能较好地区分不同种类的石斛。rbcL和matK序列扩增成功率低、NJ系统树可靠性不高,rbcL和matK序列构建的系统树中形成单系的物种支持百分比例均较低。因此ITS2序列可以作为DNA条形码用来鉴别霍山石斛和铜皮石斛、铁皮石斛。

关 键 词:DNA条形码  石斛属  RBCL  MATK  ITS2

DNA barcoding identification of Dendrobium huoshanense and its adulterants
WANG Hui,SHI Ling-ling,ZHOU Jue,ZHU Guo-ping.DNA barcoding identification of Dendrobium huoshanense and its adulterants[J].China Journal of Chinese Materia Medica,2018(20):4055-4061.
Authors:WANG Hui  SHI Ling-ling  ZHOU Jue  ZHU Guo-ping
Institution:(Anhui Provincial Key Laboratory of the Conservation and Exploitation of Biological Resources,Institute of Molecular Biology and Biotechnology ,Anhui Normal University,,Wuhu 241000,China;Wannan Medical College,Wuhu 241000,China)
Abstract:WANG Hui;SHI Ling-ling;ZHOU Jue;ZHU Guo-ping(Anhui Provincial Key Laboratory of the Conservation and Exploitation of Biological Resources,Institute of Molecular Biology and Biotechnology ,Anhui Normal University,,Wuhu 241000,China;Wannan Medical College,Wuhu 241000,China)
Keywords:DNA barcoding  Dendrobium  rbcL  matK  ITS2
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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