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生物信息学筛选分析前列腺癌发生及转移相关的枢纽基因题录
作者姓名:顾鹏  黎美琳  章民昊  何晓亮
作者单位:1. 无锡市锡山人民医院泌尿外科;2. 无锡市第五人民医院综合内科
摘    要:
目的通过生物信息学分析前列腺癌基因表达芯片谱, 寻找与前列腺癌发生及转移相关的枢纽基因。方法使用GEO2R分析基因芯片数据集GSE27616, 分别获得4个良性前列腺和5个局限性前列腺癌组织样本的差异表达基因(DEGs)、5个局限性前列腺癌和4个转移性前列腺癌组织样本配对的DEGs, 将两组DEGs取交集后得到最终DEGs。使用DAVID数据库进行GO分析、KEGG通路富集分析, 使用STRING数据库进行蛋白互作网络分析。应用Cytoscape软件中的Cytohubba 筛选得到20个枢纽基因。通过GEPIA数据库进行验证和生存分析比较。结果最终获得DEGs 388个, 其中上调基因60个, 下调基因328个。KEGG分析发现DEGs主要富集于局灶性粘连、cGMP-PKG、Rap1、cAMP等信号通路。GEPIA分析20个枢纽基因, 发现TOP2A、BIRC5、CENPF、FGF2在前列腺癌和良性组织中表达水平不同(P<0.05)。进一步筛选发现CDK1、EZH2、TOP2A、HMMR、CCNB2、CENPA、CDC45、FOXM1、BUB1、CDCA8、DLGAP5、NUSA...

关 键 词:前列腺癌  肿瘤转移  生物信息学  差异表达基因
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